Papers in Journals

Printer-friendly versionSend by email

2017

1.
X Chen, M Sterna, X Han, J Blazewicz,
Scheduling on parallel identical machines with late work criterion: Offline and online cases,
Journal of Scheduling 
2017, 
pp. 1-8.
2.
Agnieszka Mickiewicz, Joanna Sarzyńska, Maciej Miłostan, Anna Kurzyńska-Kokorniak, Agnieszka Rybarczyk, Piotr Łukasiak, Tadeusz Kuliński, Marek Figlerowicz, Jacek Błażewicz,
Modeling of the catalytic core of Arabidopsis thaliana Dicer-like 4 protein and its complex with double-stranded RNA,
Computational Biology and Chemistry 
66, 
2017, 
pp. 44-56

2016

3.
M.Marcinkowska-Swojak, L.Handschuh, P.Wojciechowski, M.Goralski, K.Tomaszewski, M.Kazmierczak, K.Lewandowski, M.Komarnicki, J.Blazewicz, M.Figlerowicz, P.Kozlowski,
Simultaneous detection of mutations and copy number variation of NPM1 in the acute myeloid leukemia using multiplex ligation-dependent probe amplification,
Mutation Research 
786, 
2016, 
pp.14-26.
4.
N. Szostak, S. Wasik, J Blazewicz,
Hypercycle,
PLoS Comput Biol 
12(4): e1004853, 
2016, 
doi:10.1371/journal.pcbi.1004853
5.
J. Blazewicz, M. Kasprzak, M. Kierzynka, W. Frohmberg, A. Swiercz, P. Wojciechowski, P. Zurkowski,
Graph algorithms for DNA sequencing - origins, current models and the future,
European Journal of Operational Research 
2016, 
doi:10.1016/j.ejor.2016.06.043
6.
P Wojciechowski, W Frohmberg, M Kierzynka, P Zurkowski, J Blazewicz,
G-MAPSEQ–a new method for mapping reads to a reference genome,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
41, 
2016, 
pp. 123-142
7.
MC Lopez-Loces, J Musial, JE Pecero, HJ Fraire-Huacuja, J Blazewicz, P Bouvry,
Exact and heuristic approaches to solve the Internet shopping optimization problem with delivery costs,
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science 
26, 
2016, 
pp. 391-406
8.
J Blazewicz, N Cheriere, PF Dutot, J Musial, D Trystram,
Novel dual discounting functions for the Internet shopping optimization problem: new algorithms,
Journal of Scheduling 
19, 
2016, 
pp. 245-255
9.
M Cichenski, F Jaehn, G Pawlak, E Pesch, G Singh, J Blazewicz,
An integrated model for the transshipment yard scheduling problem,
Journal of Scheduling 
2016, 
doi:10.1007/s10951-016-0470-4
10.
A Mickiewicz, A Rybarczyk, J Sarzynska, M Figlerowicz, J Blazewicz,
AmiRNA Designer-new method of artificial miRNA design,
Acta Biochimica Polonica 
63, 
2016, 
pp. 71-77
11.
T. Prejzendanc, S. Wasik, J. Blazewicz,
Computer representations of bioinformatics models,
Current Bioinformatics 
11 (5), 
2016, 
pp. 551-560
12.
Agnieszka Rybarczyk, Paulina Jackowiak, Marek Figlerowicz, Jacek Blazewicz,
Computational prediction of nonenzymatic RNA degradation patterns,
Acta Biochimica Polonica 
2016, 
pp. 1-15
13.
J Musial, JE Pecero, MC Lopez-Loces, HJ Fraire-Huacuja, P Bouvry, J Blazewicz,
Algorithms solving the Internet shopping optimization problem with price discounts,
Bulletin of the Polish Academy of Sciences Technical Sciences 
64 (3), 
2016, 
pp. 505-516
14.
Natalia Szostak, Szymon Wasik, Jacek Blazewicz,
Understanding Life: A Bioinformatics Perspective,
European Review 
2016, 
pp. 1-15
15.
Jacek Blazewicz, Benjamin Moseley, Erwin Pesch, Denis Trystram, Guochuan Zhang,
New challenges in scheduling theory,
Journal of Scheduling 
2016, 
pp.1-2
16.
Marcin Biesiada, Katarzyna J Purzycka, Marta Szachniuk, Jacek Blazewicz, Ryszard W Adamiak,
Automated RNA 3D Structure Prediction with RNAComposer,
RNA Structure Determination: Methods and Protocols 
2016, 
pp. 199-215
17.
M. Antczak, M. Kasprzak, P. Łukasiak, J. Błażewicz,
Structural alignment of protein descriptors - a combinatorial model,
BMC bioinformatics 
17, 
2016, 
pp.383, doi:10.1186/s12859-016-1237-9

2015

18.
K.J. Purzycka, M. Popenda, M. Szachniuk, M. Antczak, P. Lukasiak, J. Blazewicz, R.W. Adamiak,
Automated 3D RNA structure prediction using the RNAComposer method for riboswitches,
Methods in Enzymology 
2015, 
doi:10.1016/bs.mie.2014.10.050
19.
J. Blazewicz, E. Pesch, C. Phillips, D. Trystram, GC. Zhang,
New Challenges in Scheduling Theory,
RAIRO-Operations Research 
49 (2), 
2015, 
335-337, DOI: 10.1051/ro/2014047
20.
J. Blazewicz, A. Hertz, C. Picouleau, M. Widmer,
Special Issue: Eighth International Colloquium on Graphs and Optimization (GO VIII), 2012 Foreword,
DISCRETE APPLIED MATHEMATICS 
182, 
2015, 
1-1 (SI), DOI: 10.1016/j.dam.2014.11.011
21.
M. Szachniuk, M.C. De Cola, G. Felici, D. de Werra, J. Blazewicz,
Optimal pathway reconstruction on 3D NMR maps,
DISCRETE APPLIED MATHEMATICS 
182, 
2015, 
134-149 (SI), DOI: 10.1016/j.dam.2014.04.010
22.
J Blazewicz, S Kedad-Sidhoum, F Monna, G Mounié, D Trystram,
A study of scheduling problems with preemptions on multi-core computers with GPU accelerators,
Discrete Applied Mathematics 
196, 
2015, 
pp. 72-82
23.
M Guzek, A Gniewek, P Bouvry, J Musial, J Blazewicz,
Cloud Brokering: Current Practices and Upcoming Challenges,
IEEE Cloud Computing 
2, 
2015, 
(2)
24.
A.Rybarczyk, N.Szostak, M.Antczak, T.Zok, M.Popenda, R.Adamiak, J.Blazewicz, M.Szachniuk,
New in silico approach to assessing RNA secondary structures with non-canonical base pairs,
BMC Bioinformatics 
16:276, 
2015, 
DOI: 10.1186/s12859-015-0718-6
25.
G Kendall, R Bai, J Błazewicz, PD Causmaecker, M Gendreau, R John, J Li, B McCollum, E Pesch, R Qu, N Sabar, GV Berghe, A Yee,
Good Laboratory Practice for optimization research,
Journal of the Operational Research Society 
2015, 
doi: 10.1057/jors.2015.77
26.
T Zok, M Antczak, M Riedel, D Nebel, T Villmann, P Lukasiak, J Blazewicz, M.Szachniuk,
Building the Library of Rna 3D Nucleotide Conformations Using the Clustering Approach,
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science 
20, 
2015, 
pp.689-700
27.
P.Lukasiak, M.Antczak, T.Ratajczak, M.Szachniuk, M.Popenda, R.W. Adamiak, J.Blazewicz,
RNAssess a web server for quality assessment of RNA 3D structures,
Nucleic Acids Research 
2015, 
doi: 10.1093/nar/gkv557
28.
J. Blazewicz, E. Pesch, D.Trystram, G.C. Zhang,
New perspectives in scheduling theory,
Journal of Scheduling 
18, 
2015, 
pp. 333-334.

2014

29.
G-W Weber, J Blazewicz, M Rauner, M Türkay,
Recent advances in computational biology, bioinformatics, medicine, and healthcare by modern OR,
CEJOR 
22, 
2014, 
pp. 427-430.
30.
A. Swiercz, E.K. Burke, M. Cicheński, G. Pawlak, S. Petrovic, T. Zurkowski, J. Blazewicz,
Unified encoding for hyper-heuristics with application to bioinformatics,
CEJOR 
22, 
2014, 
pp.567-589.
31.
S. Wasik, P. Jackowiak, M. Figlerowicz, J. Blazewicz,
Multi-agent model of hepatitis c virus infection,
Artificial intelligence in medicine 
60, 
2014, 
pp.123-131.
32.
M. Szachniuk, M.C. De Cola, G. Felici, J. Blazewicz,
The Orderly Colored Longest Path Problem - a survey of applications and new algorithms,
RAIRO Operations Research 
48(1), 
2014, 
pp.25-51.
33.
J.Błażewicz, P.Bouvry, M.Kovalyov, J.Musiał,
Internet shopping with price sensitive discounts,
4OR-A Quarterly for Operations Research 
12, 
2014, 
pp. 35-48.
34.
P. Wojciechowski, P. Formanowicz, J Blazewicz,
Reference alignment based methods for quality evaluation of multiple sequence alignment - a survey,
Current Bioinformatics 
9, 
2014, 
pp. 44-56.
35.
A. Swiercz, B. Bosak, M. Chłopkowski, A. Hoffa, M. Kasprzak, K. Kurowski, T. Piontek, J. Błazewicz,
Preprocessing and storing high-throughput sequencing data,
Computational Methods in Science and Technology 
20, 
2014, 
pp. 9-20
36.
M. Szachniuk, M.C. De Cola, G. Felici, D. de Werra, J. Blazewicz,
Optimal pathway reconstruction on 3D NMR maps,
Discrete Applied Mathematics 
2014, 
doi:10.1016/j.dam.2014.04.010
37.
J. Blazewicz, N. Cheriere, P.-F. Dutot, J. Musial, D. Trystram,
Novel dual discounting functions for the Internet shopping optimization problem: new algorithms,
Journal of Scheduling 
2014, 
DOI. 10.1007/s10951-014-0390-0
38.
J. Blazewicz, P. Bouvry, M.Y. Kovalyov, J. Musial ,
Erratum to: Internet shopping with price-sensitive discounts,
4OR-A Quarterly for Operations Research 
12, 
2014, 
pp 403-406
39.
N.Szostak, F.Royo, A.Rybarczyk, M.Szachniuk, J.Blazewicz, A.del Sol, J.M.Falcon-Perez,
Sorting signal targeting mRNA into hepatic extracellular vesicles,
RNA Biology 
7, 
2014, 
pp. 836-844
40.
M Antczak, T Zok, M Popenda, P Lukasiak, RW Adamiak, J Blazewicz, M Szachniuk,
RNApdbee-a webserver to derive secondary structures from pdb files of knotted and unknotted RNAs,
Nucleic Acid Research 
42, 
2014, 
pp. W368-W372

2013

41.
M. Kierzynka, J. Błażewicz, W. Frohmberg, P. Wojciechowski,
G-MSA - GPU-based, fast and accurate algorithm for multiple sequence alignment,
Journal of Parallel and Distributed Computing 
73, 
2013, 
pp.32-41.
42.
J. Blazewicz, W. Frohmberg, P. Gawron, M. Kasprzak, M. Kierzynka, A. Swiercz, P. Wojciechowski,
DNA sequence assembly involving an acyclic graph model,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
38, 
2013, 
pp. 25-34.
43.
M. Szachniuk, M. Malaczynski, E. Pesch, E.K. Burke, J. Blazewicz,
MLP accompanied beam search for the resonance assignment problem,
Journal of Heuristics 
19(3), 
2013, 
pp. 443-464.
44.
P. Lukasiak, M. Antczak, T. Ratajczak, J. Bujnicki, M. Szachniuk, M. Popenda, R. Adamiak, J. Blazewicz,
RNAlyzer - novel approach for quality analysis of RNA structural models,
Nucleic Acid Research 
41, 
2013, 
pp. 5978-5990
45.
J. Błażewicz, E.K. Burke, G. Kendall, W. Mruczkiewicz, C. Oguz, A. Świercz,
A hyper-heuristic approach to sequencing by hybridization of DNA sequences,
Annals of Operations Research 
207 (1), 
2013, 
pp. 27-41
46.
M.Bender, J.Blazewicz, E.Pesch, D. Trystram, G.C.Zhang,
New trends in scheduling,
Journal of Scheduling 
16, 
2013, 
pp.347-348
47.
S. Wasik, T. Prejzendanc, J. Blazewicz,
Modelang -- a new approach for experts-friendly viral infections modeling,
Computational and Mathematical Methods in Medicine 
2013, 
2013, 
pp. 1-8.
48.
W. Frohmberg, M. Kierzynka, J. Blazewicz, P. Gawron, and P. Wojciechowski,
G-DNA - a highly efficient multi-GPU/MPI tool for aligning nucleotide reads,
Bulletin of the Polish Academy of Sciences-Technical Sciences 
61(4), 
2013, 
pp. 989–992

2012

49.
J. Błażewicz, M. Borowski, W. Chaara, P. Kędziora, D. Klatzmann, P. Łukasiak, A. Six, P. Wojciechowski,
GeVaDSs - decision support system for novel Genetic Vaccine development process,
BMC Bioinformatics 
2012, 
13:91
50.
J. Błażewicz, M.Kasprzak,
Complexity issues in computational biology,
Fundamenta Informaticae 
118, 
2012, 
pp. 385-401
51.
J. Błażewicz, E.K. Burke, V.S. Gordon, M.Y. Kovalyov, Y. M. Shafransky, V.A. Strusevich,
Editorial: new branches, old roots,
Journal of Scheduling 
15, 
2012, 
pp. 399-401
52.
R. Bai, J. Błażewicz, E.K. Burke, G. Kendall, B. McCollum,
A simulated annealing hyper-heuristic methodology for flexible decision support,
4OR-A Quarterly Journal of Operations Research 
10, 
2012, 
pp. 43-66
53.
J. Błażewicz, B. Bosak, P. Gawron, M. Kasprzak, K. Kurowski, T. Piontek, A. Świercz,
Highly efficient parallel approach to the next-generation DNA sequencing,
Lecture Notes in Computer Science 
7204, 
2012, 
pp. 262-271
54.
J. Błażewicz, M. Kasprzak,
Reduced-by-matching graphs: toward simplifying Hamiltonian circuit problem,
Fundamenta Informaticae 
118, 
2012, 
pp. 225-244
55.
M. Radom, A. Rybarczyk, R. Kottmann, P. Formanowicz, M. Szachniuk, F.O. Glöckner, D. Rebholz-Schuhmann, J. Błażewicz,
Poseidon: An information retrieval and extraction system for metagenomic marine science,
Ecological Informatics 
12, 
2012, 
pp. 10-15
56.
J. Błażewicz, G. Pawlak, M. Tanaś, W. Wojciechowicz,
New algorithms for coupled tasks scheduling- a survey,
RAIRO - Operations Research 
46, 
2012, 
pp. 335-353
57.
M. Popenda, M. Szachniuk, M. Antczak, K. Purzycka, P. Łukasiak, N. Bartol, J. Błażewicz, R. Adamiak,
Automated 3D structure composition for large RNAs,
Nucleic Acid Research 
40(14), 
2012, 
e112
58.
W. Frohmberg, M. Kierzynka J. Błażewicz, P. Wojciechowski,
G-PAS 2.0-an improved version of protein alignment tool with an efficient backtracking routine on multiple GPUs,
Bulletin of the Polish Academy of Sciences-Technical Sciences 
60, 
2012, 
pp. 491-494

2011

59.
J.Błażewicz, E.K.Burke, M.Kasprzak, A.Kovalev, M.Kovalyov,
The Simplified Partial Digest Problem: approximation and a graph-theoretic model,
European Journal of Operational Research 
208, 
2011, 
pp.142-152
60.
J.Błażewicz, P.Formanowicz, P.Kędziora, P.Marciniak, P.Taront,
Adaptive memory programming: local search parallel algorithms for phylogenetic tree construction,
Annals of Operations Research 
183, 
2011, 
pp.75-94
61.
S. Bąk, J. Błażewicz, G. Pawlak, M. Plaza, E.K. Burke, G. Kendall,
A parallel branch and bound approach to the rectangular guillotine strip cutting problem,
INFORMS J. on Computing 
23, 
2011, 
pp. 15-25
62.
J. Błażewicz, M. Figlerowicz, M. Kasprzak, M. Nowacka, A. Rybarczyk,
RNA Partial Degradation Problem: motivation, complexity, algorithm,
Journal of Computational Biology 
18, 
2011, 
pp.1-14
63.
J. Błażewicz, T.C.E. Cheng, M. Machowiak, C. Oguz,
Berth and quay crane allocation: a moldable task scheduling model,
Journal of the Operational Research Society 
62, 
2011, 
pp. 1189-1197
64.
D. Formanowicz, A. Sackmann, A. Kozak, J. Błażewicz, P. Formanowicz,
Some aspects of the anemia of chronic disorders modeled and analyzed by petri net based approach,
Bioprocess and Biosystems Engineering 
34, 
2011, 
pp. 581-595
65.
J. Błażewicz, W. Frohmberg, M. Kierzynka, E. Pesch, P. Wojciechowski,
Protein alignment algorithms with an efficient backtracking routine on multiple GPUs,
BMC Bioinformatics 
12, 
2011, 
181
66.
J.Błażewicz, V.Boljuncic, S.Martello, J.Skorin-Kapov,
Combinatorial Optimization Issues in Scheduling,
Journal of Scheduling 
14, 
2011, 
pp. 221-223.
67.
Y. Orlovich, J. Błażewicz, A. Dolgui, G. Finke, V. Gordon,
On the complexity of the independent set problem in triangle graphs,
Discrete Mathematics 
311, 
2011, 
pp.1670-1680
68.
M. Antczak, J. Błażewicz, P. Łukasiak, M. Miłostan, N. Krasnogor, G. Palik,
DomAns - pattern based method for protein domain boundaries prediction and analysis,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
36, 
2011, 
pp. 99-119

2010

69.
P. Łukasiak, J. Błażewicz, M. Miłostan,
Some operations research methods for analyzing protein sequences and structures,
Annals of Operations Research 
175, 
2010, 
pp. 9-35
70.
S. Wąsik, P. Jackowiak, P. Kędziora, J. Krawczyk, P. Formanowicz, M. Figlerowicz, J. Błażewicz,
Towards prediction of HCV therapy efficiency,
Computational and Mathematical Methods in Medicine 
11, 
2010, 
pp. 185-199
71.
J.Błażewicz, M.Borowski, P.Formanowicz, T.Głowacki,
Genetic and tabu search algorithms for peptide assembly problems,
RAIRO - Operations Research 
44, 
2010, 
pp. 153-166
72.
J.Błażewicz, J.Musiał, M.Kovalyov, A.Urbański, A.Wojciechowski,
Internet Shopping Optimization problem,
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science 
20, 
2010, 
pp. 385-390
73.
J. Błażewicz, K. Ecker, T. Kis, C.N. Potts, M. Tanas, J. Whitehead,
Scheduling of coupled tasks with unit processing times,
Journal of Scheduling 
13, 
2010, 
pp. 453-461
74.
M.Bender, J.Błażewicz, E.Pesch, D.Trystram, G.Zhang,
New challenges in scheduling theory,
Journal of Scheduling 
13, 
2010, 
pp. 451-452
75.
M. Figlerowicz, P. Jackowiak, P. Formanowicz, P. Kędziora, M. Alejska, N. Malinowska, J. Błażewicz, M. Figlerowicz,
Hepatitis C virus quasispecies in chronically infected children subjected to interferon–ribavirin therapy,
Archives of Virology 
155, 
2010, 
pp. 1977-1987
76.
M.Popenda, M.Szachniuk, M.Błażewicz, S.Wąsik, E.K.Burke, J.Błażewicz, R.W.Adamiak,
RNA FRABASE 2.0: an advanced web-accessible database with the capacity to search the three-dimensional fragments within RNA structures,
BMC Bioinformatics 
11, 
2010, 
231
77.
J. Sarzyńska, A. Mickiewicz, M. Miłostan, P. Łukasiak, J. Błażewicz, M. Figlerowicz, T. Kuliński,
Flexibility of Dicer studied by implicit solvent molecular dynamics simulations,
Computational Methods in Science and Technology 
16, 
2010, 
pp. 97-104
78.
P. Bertolazzi, J. Błażewicz, M. Turkay,
Operations Research Models for Computational Biology, Bioinformatics and Medicine,
J Math Model Algor 
9, 
2010, 
pp. 209–211

2009

79.
A. Sackmann, D. Formanowicz, P. Formanowicz, J. Błażewicz,
New insights into the human body iron metabolism analyzed by a Petri net based approach,
Biosystems 
96, 
2009, 
pp. 104-113
80.
J. Podkowiński, A. Żmienko, B. Florek, P. Wojciechowski, A. Rybarczyk, J. Wrzesiński, J. Ciesiołka, J. Błażewicz, A. Kondorosi, M. Crespi, A. Legocki,
Translational and structural analysis of the shortest legume enod40 gene in Lupinus luteus.,
Acta Biochimica Polonica 
56, 
2009, 
pp. 89-102
81.
J. Błażewicz, M. Bryja, M. Figlerowicz, P. Gawron, M. Kasprzak, E. Kirton, D. Platt, J. Przybytek, A. Świercz, L. Szajkowski,
Whole genome assembly from 454 sequencing output via modified DNA graph concept,
Computational Biology and Chemistry 
33, 
2009, 
pp. 224-230
82.
J.R. Nawrocki, W. Complak, J. Błażewicz, S. Kopczyńska, M. Maćkowiak,
The Knapsack-Lightening problem and its application to scheduling HRT tasks,
Bulletin of the Polish Academy of Sciences, Technical Sciences 
57, 
2009, 
pp. 71-77
83.
J. Błażewicz, D. Formanowicz, P. Formanowicz, A. Sackmann, M. Sajkowski,
Modeling the process of human body iron homeostasis using a variant of timed Petri nets,
Discrete Applied Mathematics 
157, 
2009, 
pp. 2221-2231
84.
M. Figlerowicz, P. Jackowiak, M. Alejska, N. Malinowska, A. Kowala-Piaskowska, P. Kędziora, P. Formanowicz, J. Błażewicz, M. Figlerowicz,
Two types of viral quasispecies identified in children suffering from chronic hepatitis C,
Journal of Hepatology 
55:27, 
2009, 
pp.
85.
J. Błażewicz, D. Formanowicz, P. Formanowicz,
Zastosowanie sieci Petriego do modelowania procesów biologicznych,
Kosmos 
58 (1-2), 
2009, 
pp. 79-88
86.
J. Błażewicz, P. Łukasiak,
System wspomagania wytwarzania i analizy szczepionek genetycznych,
Kosmos 
58 (1-2), 
2009, 
pp. 113-126
87.
J. Błażewicz, E. Burke, M. Kasprzak, A. Kovalev, M.Y. Kovalyov,
On the approximability of the Simplified Partial Digest problem,
Discrete Applied Mathematics 
157, 
2009, 
pp. 3586-3592
88.
J. Błażewicz, P. Łukasiak, M. Miłostan, N. Krasnogor, P. Jackowiak,
Sequence Similarity Based Method For Protein Function Prediction,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
34, 
2009, 
pp. 173-192
89.
J. Błażewicz, P. Formanowicz, P. Wojciechowski,
Some remarks on evaluation of quality of the multiple sequence alignment based on BAliBASE benchmark,
International Journal of Applied Mathematics and Computer Science 
19, 
2009, 
pp. 675-678

2008

90.
N. Krasnogor, A.A. Shah, D. Barthel, P. łukasiak, J. Błażewicz,
Web and Grid technologies in bioinformatics, computational and systems biology: a review,
Current Bioinformatics 
3, 
2008, 
pp. 10-31
91.
J. Błażewicz, M. Kasprzak,
Graph reduction and its application to DNA sequence assembly,
Bulletin of the Polish Academy of Sciences, Technical Sciences 
56, 
2008, 
pp. 65-70
92.
M. Bender, J. Błażewicz, K. Ecker, E. Pesch, D. Trystram,
Emerging scheduling applications,
Journal of Scheduling 
11, 
2008, 
pp. 309-310
93.
M. Stobiecki, M. Borowski, K. Rosiak, P. Kachlicki, D. Muth, J. Błażewicz,
Plant phenolic secondary metabolites mass spectra database,
Acta Biochimica Polonica 
55, Suppl.2, 
2008, 
P3.9
94.
J. Błażewicz, M. Kasprzak, B. Leroy-Beaulieu, D. de Werra,
Finding Hamiltonian circuits in quasi-adjoint graphs,
Discrete Applied Mathematics 
156, 
2008, 
pp.2573-2580
95.
J. Błażewicz, E. Pesch, M. Sterna, F. Werner,
Metaheuristic approaches for the two-machine flow-shop problem with weighted late work criterion and common due date,
Computers & Operations Research 
35, 
2008, 
pp.574-599

2007

96.
A. Sackmann, D. Formanowicz, P. Formanowicz, I. Koch, J. Błażewicz,
An analysis of the Petri net based model of the human body iron homeostasis process,
Computational Biology and Chemistry 
31, 
2007, 
pp.1-10
97.
D. Formanowicz, A. Sackmann, P. Formanowicz, J. Błażewicz,
Petri net based model of the body iron homeostasis,
Journal of Biomedical Informatics 
40, 
2007, 
pp.476-485
98.
J. Błażewicz, E. Pesch, M. Sterna, F. Werner,
A note on two-machine job shop with weighted late work criterion,
Journal of Scheduling 
10, 
2007, 
pp.87-95
99.
J. Błażewicz, E. Burke, K. Ecker, E. Pesch, D. Trystram,
Selected papers from the Dagstuhl workshop - On scheduling in computer and manufacturing systems,
Journal of Scheduling 
10, 
2007, 
pp.85-86
100.
J. Błażewicz, P. Formanowicz, M. Kasprzak, P. Schuurman, G.J. Woeginger,
A polynomial time equivalence between DNA sequencing and the exact perfect matching problem,
Discrete Optimization 
4, 
2007, 
pp.154-162
101.
J. Błażewicz, P. Łukasiak, S. Wilk,
New machine learning methods for prediction of protein secondary structure,
Control and Cybernetics 
36, 
2007, 
pp.183-201
102.
W. Jaśkowski, J. Błażewicz, P. Łukasiak, M. Miłostan, N. Krasnogor,
3D-Judge - A Metaserver Approach to Protein Structure Prediction,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
32, 
2007, 
pp. 3-14
103.
D. Barthel, J.D. Hirst, J. Blazewicz, E.K. Burke, N. Krasnogor,
ProCKSI: A Decision Support System for Protein (Structure) Comparison, Knowledge, Similarity and Information,
BMC Bioinformatics 
14:56, 
2007, 
pp.
104.
J. Błażewicz, E. Burke, M. Kasprzak, A. Kovalev, M.Y. Kovalyov,
Simplified partial digest problem: enumerative and dynamic programming algorithms,
IEEE/ACM Trans. on Computational Biology and Bioinformatics 
4, 
2007, 
pp. 668-680

2006

105.
J. Błażewicz, M.Y. Kovalyov, M. Machowiak, D. Trystram, J. Węglarz,
Preemptable malleable task scheduling problem,
IEEE Transactions on Computers 
55, 
2006, 
pp.486-490
106.
M. Stout, J. Bacardit, J. D.Hirst, N. Krasnogor, J. Błażewicz,
From HP Lattice Models to Real Proteins: Coordination Number Prediction Using Learning Classifier Systems,
Lecture Notes in Computer Science 
3907, 
2006, 
pp.208-220
107.
J. Błażewicz, M. Kasprzak,
Computational complexity of isothermic DNA sequencing by hybridization,
Discrete Applied Mathematics 
154, 
2006, 
pp.718-729
108.
J. Błażewicz, P.Łukasiak, M.Miłostan,,
Some operations research methods for analyzing protein sequences and structures,
4OR: A Quarterly Journal of Operations Research 
4, 
2006, 
pp.91 - 123
109.
J. Błażewicz, F. Glover, M. Kasprzak, W.T. Markiewicz, C. Oğuz, D. Rebholz-Schuhmann, A. Świercz,
Dealing with repetitions in sequencing by hybridization,
Computational Biology and Chemistry 
30, 
2006, 
pp 313-320
110.
J. Błażewicz, B. Dziurdza, W.T.Markiewicz, C. Oğuz,
The parallel genetic algorithm for designing DNA randomizations in a combinatorial protein experiment,
Lecture Notes In Computer Science 
3911, 
2006, 
pp. 1097-1105
111.
J. Błażewicz, C. Oğuz, A. Świercz, J. Węglarz,
DNA sequencing by hybridization via genetic search,
Operations Research 
54, 
2006, 
pp.1185-1192
112.
A. Spik, S. Oczkowski, A. Olszak, M. Kotecki, P. Formanowicz, J. Błażewicz, J. Jaruzelska,
Candidate mRNAs interacting with fertility protein PUMILIO2 in the human germ line,
Reproductive Biology 
6, 
2006, 
pp.37-42
113.
A. Spik, S. Oczkowski, A. Olszak, P. Formanowicz, J. Błażewicz, J. Jaruzelska,
Human fertility protein PUMILIO2 interacts in vitro with testis mRNA encoding Cdc42 effector 3 (CEP3),
Reproductive Biology 
6, 
2006, 
pp.103-113

2005

114.
C. Sadfi, B. Penz, C. Rapine, J. Błażewicz, P. Formanowicz,
An improved approximation algorithm for the single machine total completion time scheduling problem with availability constraints,
European Journal of Operational Research 
161, 
2005, 
pp.3-10
115.
J. Błażewicz, P. Formanowicz, M. Kasprzak,
Selected combinatiorial problems of computational biology,
European Journal of Operational Research 
161, 
2005, 
pp.585-597
116.
J. Błażewicz, E. Pesch, M. Sterna,
A novel representation of graph structures in web mining and data analysis,
Omega 
33, 
2005, 
pp.65-71
117.
J. Błażewicz, E. Pesch, M. Sterna, F. Werner,
The two-machine flow-shop problem with weighted late work criterion and common due-date,
European Journal of Operational Research 
165, 
2005, 
pp.408-415
118.
J. Błażewicz, F. Glover, M. Kasprzak,
Evolutionary approaches to DNA sequencing with errors,
Annals of Operations Research 
138, 
2005, 
pp.67-78
119.
J. Błażewicz, P. Formanowicz,
Multistage isothermic sequencing by hybridization,
Computational Biology and Chemistry 
29, 
2005, 
pp.69-77
120.
A. Urbanowicz, M. Alejska, P. Formanowicz, J. Błażewicz, M. Figlerowicz, J.J. Bujarski,
Homologous Crossovers among Molecules of Brome Mosaic Bromovirus RNA1 or RNA2 Segments in vivo,
Journal of Virology 
79, 
2005, 
pp.5732-5742
121.
J. Błażewicz, P. Łukasiak, M. Miłostan,
Application of tabu search strategy for finding low energy structure of protein,
Artificial Intelligence in Medicine 
35, 
2005, 
pp.135-145
122.
J. Błażewicz, P.L. Hammer, P. Łukasiak,
Predicting secondary structures of proteins,
IEEE Engineering in Medicine and Biology 
24, 
2005, 
pp.88-94
123.
J. Błażewicz, M. Szachniuk, A. Wójtowicz,
RNA tertiary structure determination: NOE pathways construction by tabu search,
Bioinformatics 
21, 
2005, 
pp.2356-2361
124.
J. Błażewicz, M. Borowski, P. Formanowicz, M. Stobiecki,
Tabu search method for determining sequences of amino acids in long polypeptides,
Lecture Notes in Computer Science 
3449, 
2005, 
pp. 22-32
125.
J. Błażewicz, E. Pesch, M. Sterna, F. Werner,
Metaheuristics for late work minimization in two-machine flow shops with common due date,
Lecture Notes in Artificial Intelligence 
3698, 
2005, 
pp. 222- 234
126.
J. Błażewicz, M. Borowski, P. Formanowicz, T. Głowacki,
On graph theoretical models for peptide sequence assembly,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
30, 
2005, 
pp. 183-191
127.
P. Kędziora, M. Figlerowicz, P. Formanowicz, M. Alejska, P. Jackowiak, N. Malinowska, A. Frątczak, J. Błażewicz, M. Figlerowicz,
Computational methods in diagnostics of chronic hepatitis C,
Bulletin of the Polish Academy of Sciences, Technical Sciences 
53, 
2005, 
pp. 273-281
128.
M. Figlerowicz, P. Formanowicz, P. Kędziora, M. Alejska, P. Jackowiak, J. Błażewicz, W. Służewski, M. Figlerowicz,
Znaczenie kliniczne zmian w populacji HCV w pierwszych tygodniach leczenia przewlekłgo zapalenia wątroby typu C interferonem i rybawiryną,
Przegląd Epidemiologiczny 
59, 
2005, 
pp. 581-590
129.
J. Błażewicz, E. Pesch, M. Sterna, F. Werner,
A comparison of solution procedures for two-machine flow shop scheduling with late work criterion,
Computers and Industrial Engineering 
49, 
2005, 
pp. 611-624
130.
J. Błażewicz, K. Ecker, D. Trystram,
Recent advances in scheduling in computer and manufacturing systems,
European Journal of Operational Research 
164, 
2005, 
pp.573-574
131.
P. Formanowicz, L. Handschuh, R. Urbaniak, J. Błażewicz, M. Figlerowicz,
Projektowanie macierzy DNA,
Na Pograniczu Chemii i Biologii 
XII, 
2005, 
pp. 513-530
132.
J. Błażewicz, M. Kasprzak,
Combinatorial optimization in DNA mapping - a computational thread of the Simplified Partial Digest Problem,
RAIRO - Operations Research 
39, 
2005, 
pp.227-242

2004

133.
J. Błażewicz, M. Kovalyov, M. Machowiak, D. Trystram, J. Węglarz,
Scheduling malleable tasks on parallel processors to minimize the makespan,
Annals of Operations Research 
129, 
2004, 
pp. 65-80
134.
J. Błażewicz, E. Pesch, M. Sterna, F. Werner,
Open shop scheduling problems with late work criteria,
Discrete Applied Mathematics 
134, 
2004, 
pp. 1-24
135.
J. Błażewicz, E. Burke, M. Jaroszewski, M. Kasprzak, B. Paliświat, M. Pryputniewicz,
On the complexity of the Double Digest Problem,
Control and Cybernetics 
33, 
2004, 
pp. 133-140
136.
J. Błażewicz, F. Glover, M. Kasprzak,
DNA sequencing - tabu and scatter search combined,
INFORMS Journal on Computing 
16, 
2004, 
pp. 232-240
137.
J. Błażewicz, P. Formanowicz, M. Kasprzak, W. T. Markiewicz, A. Świercz,
Tabu search algorithm for DNA sequencing by hybridization with isothermic libraries,
Computational Biology and Chemistry 
28, 
2004, 
pp. 11-19
138.
R.W. Adamiak, J. Błażewicz, P. Formanowicz, Z. Gdaniec, M. Kasprzak, M. Popenda, M. Szachniuk,
An algorithm for an automatic NOE pathways analysis of 2D NMR spectra of RNA duplexes,
Journal of Computational Biology 
11, 
2004, 
pp. 167-183
139.
J. Błażewicz, A. Moret-Salvador, R. Walkowiak,
Parallel tabu search approaches for two-dimensional cutting,
Parallel Processing Letters 
14, 
2004, 
pp. 23-32
140.
J. Błażewicz, P. Formanowicz, P. Kędziora, P. Wojciechowski,
Parallel algorithms for evolutionary history reconstruction,
Lecture Notes in Computer Science 
3019, 
2004, 
pp. 1138-1145
141.
J. Błażewicz, K. Dill, P. Łukasiak, M. Miłostan,
A tabu search strategy for finding low energy structures of proteins in HP-model,
Computational Methods in Science and Technology 
10, 
2004, 
pp. 7-19
142.
J. Błażewicz, P.Formanowicz, M. Kasprzak, W.T. Markiewicz,
Sequencing by hybridization with isothermic oligonucleotide libraries,
Discrete Applied Mathematics 
145, 
2004, 
pp. 40-51
143.
J. Błażewicz, M. Figlerowicz, P. Formanowicz, M. Kasprzak, B. Nowierski, R. Styszyński, Ł. Szajkowski, P. Widera, M. Wiktorczyk,
Assembling SARS-CoV genome - new method based on graph theoretic approach,
Acta Biochimica Polonica 
51, 
2004, 
pp.983-993
144.
J. Błażewicz, M. Szachniuk, A. Wójtowicz,
Evolutionary algorithm for a reconstruction of NOE paths in NMR spectra of RNA chain,
Bulletin of the Polish Academy of Sciences, Technical Sciences 
52, 
2004, 
pp.221-230
145.
J. Błażewicz, E. Pesch, M. Sterna, F. Werner,
Flow shop scheduling with late work criterion - choosing the best solution strategy,
Lecture Notes in Computer Science 
3285, 
2004, 
pp.68-75

2003

146.
J. Błażewicz, M. Kasprzak,
Complexity of DNA sequencing by hybridization,
Theoretical Computer Science 
290, 
2003, 
pp.1459-1473
147.
J. Błażewicz, P.Formanowicz, R. Urbaniak,
DNA based algorithms for some scheduling problems,
Lecture Notes in Computer Science 
2611, 
2003, 
pp. 673-683
148.
J. Błażewicz, M. Jaroszewski,
New algorithm for the Simplified Partial Digest Problem,
Lecture Notes in Bioinformatics 
2812, 
2003, 
pp. 95-110
149.
J. Błażewicz, P. Dell'Olmo, M. Drozdowski, P. Mączka,
Scheduling multiprocessor tasks on parallel processors with limited availibility,
European Journal of Operational Research 
149, 
2003, 
pp. 377-389
150.
J. Błażewicz, B. Dziurdza, W. T. Markiewicz,
Artificial evolution. An algorithm for an exploration of the amino acid sequences spaces,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
28, 
2003, 
pp. 195-209

2002

151.
J. Błażewicz, P. Formanowicz,
Scheduling jobs in open shops with limited machine availability,
RAIRO-RO 
36, 
2002, 
pp.149-156
152.
J. Błażewicz, P. Dell'Olmo, M. Drozdowski,
Scheduling multiprocessor tasks on two parallel processors,
RAIRO-RO 
36, 
2002, 
pp. 37-51
153.
J. Błażewicz, M. Kasprzak, W. Kuroczycki,
Hybrid genetic algorithm for DNA sequencing with errors,
Journal of Heuristics 
8, 
2002, 
pp. 495-502
154.
J. Błażewicz, P. Formanowicz, M. Kasprzak, D. Kobler,
On the recognition of de Bruijn graphs and their induced subgraphs,
Discrete Mathematics 
245, 
2002, 
pp.81-92
155.
W. Kubiak, J. Błażewicz, J. Breit, P. Formanowicz, G. Schmidt,
Flow shops with limited machine availability,
European Journal of Operational Research 
136, 
2002, 
pp.528-540
156.
J. Błażewicz, Z. Liu,
Linear and quadratic algorithms for scheduling chains and opposite chains,
European Journal of Operational Research 
137, 
2002, 
pp. 248-264
157.
J. Błażewicz, M. Kovalyov,
The complexity of two group scheduling problems,
Journal of Scheduling 
5, 
2002, 
pp.477-485
158.
J. Błażewicz, D. Kobler,
Review of properties of different precedence graphs for scheduling problems,
European Journal of Operational Research 
142, 
2002, 
pp.435-443
159.
J. Błażewicz, R. Walkowiak,
A new parallel approach for multi-dimensional packing problem,
Lecture Notes in Computer Science 
2328, 
2002, 
pp.194-201
160.
J. Błażewicz, P. Formanowicz, F. Guinand, M. Kasprzak,
A heuristic managing errors for DNA sequencing,
Bioinformatics 
18, 
2002, 
pp. 652-660
161.
J. Błażewicz, G. Pawlak, B. Walter,
Scheduling production tasks in a two stage FMS,
International Journal of Production Research 
40, 
2002, 
pp.4341-4352
162.
J. Błażewicz, M. Kovalyov, M. Machowiak, D. Trystram, J. Węglarz,
Szeregowanie zadań elastycznych,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej s. Automatyka 
134, 
2002, 
pp.67-80
163.
J. Błażewicz, K. Ecker, T. Kis, M. Tanaś,
Scheduling coupled tasks on a single processor,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej s. Automatyka 
134, 
2002, 
pp.53-66
164.
J. Błażewicz, P. Giera, R. Klaus,
Lokalizacja i sterowanie maszynami z wykorzystaniem systemu GPS,
Przegląd Komunalny 
10, 
2002, 
pp.44-46
165.
J. Błażewicz, P. Formanowicz, M. Kasprzak, P. Schuurman, G. Woeginger,
DNA sequencing, Eulerian graphs, and the exact perfect matching problem,
Lecture Notes in Computer Science 
2573, 
2002, 
pp.13-24
166.
J. Błażewicz, K. Ecker, T. Kis, M. Tanaś,
A note on the complexity of scheduling coupled tasks on a single processor,
Journal of the Brazilan Computer Society 
7, 
2002, 
pp.23-26
167.
J. Błażewicz, R. Klaus,
Zarządzanie parkiem maszyn roboczych z aktywnej bazy danych,
Problemy Maszyn Roboczych 
20, 
2002, 
pp. 23-32
168.
J. Błażewicz, P. Giera, R. Klaus,
System monitorowania maszyn roboczych,
Problemy Maszyn Roboczych 
20, 
2002, 
pp. 33-40

2001

169.
J. Błażewicz, F. Guinaud, B. Penz, D. Trystram,
Scheduling complete trees on two uniform processors with integer speed ratios and communication delays,
Parallel Processing Letters 
10, 
2001, 
pp. 267-277
170.
J. Błażewicz, P. Hammer, P. Lukasiak,
Prediction of protein secondary structure using Logical Analysis of Data algorithm,
Computational Methods in Science and Technology 
7, 
2001, 
pp. 7-25
171.
J. Błażewicz, M. Machowiak, G. Mounie, D. Trystram,
Suboptimal approaches to scheduling malleable tasks,
Computational Methods in Science and Technology 
6, 
2001, 
pp. 25-41
172.
J. Błażewicz, M. Ratajczyk,
Drzewa filogenetyczne - informatyczne problemy badawcze,
ProDialog 
12, 
2001, 
pp. 1-32
173.
J. Błażewicz, R. Klaus,
Integracja procesów logistycznych i monitorowania stanów maszyn roboczych,
Zeszyty Naukowe Politechniki Opolskiej s. Mechanika 
64, 
2001, 
pp. 23-27
174.
J. Błażewicz, P. Formanowicz, M. Jaroszewski, M. Kasprzak, W. Markiewicz,
Construction of DNA restriction maps based on a simplified experiment,
Bioinformatics 
17, 
2001, 
pp. 398-404
175.
J. Błażewicz, J. Breit, P. Formanowicz, W. Kubiak, G. Schmidt,
Heuristic algorithms for the two-machine flowshop with limited machine availability,
Omega 
29, 
2001, 
pp.599-608
176.
J. Błażewicz, M. Machowiak, G, Mounie, D. Trystram,
Approximation Algorithms for Scheduling Independent Malleable Tasks,
Lecture Notes in Computer Science 
2150, 
2001, 
pp. 198-203
177.
J. Błażewicz, P. Formanowicz, M. Kasprzak, K. Michalak, P. Wierzejewski,
Clustal W algorithm for multiple sequence alignment revisited,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
26, 
2001, 
pp. 189-196

2000

178.
J.Błażewicz, P.Formanowicz, M.Kasprzak, W.T.Markiewicz, J.Węglarz,
Tabu search for DNA sequencing with false negatives and false positivies,
European Journal of Operational Research 
125, 
2000, 
pp. 257-265
179.
J.Błażewicz, M.Drozdowski, P.Formanowicz, W.Kubiak, G.Schmidt,
Scheduling preemptable tasks on parallel processors with limited availability,
Parallel Computing 
26, 
2000, 
pp. 1195-1211
180.
J.Błażewicz, P.Formanowicz, W.Kubiak, G.Schmidt,
Parallel branch and bound algorithm for the flow shop problem with limited machine availability,
Bulletin of the Polish Academy of Sciences, s.Computer Science 
48, 
2000, 
pp. 105-115
181.
J. Błażewicz, E. Pesch, M. Sterna,
The disjunctive machine representation of the job shop scheduling problem,
European Journal of Operational Research 
127, 
2000, 
pp. 317-331
182.
J. Błażewicz, M. Machowiak, G. Mounie, D. Trystram, J. Węglarz,
Scheduling malleable tasks with convex processing speed functions,
Computation y Sistemas 
4, 
2000, 
pp. 158-165

1999

183.
J.Błażewicz, M.Drozdowski, M.Markiewicz,
Divisible task scheduling - concept and verification,
Parallel Computing 
25, 
1999, 
pp.87-99
184.
J.Błażewicz, E.Pesch, M.Sterna,
A note on disjunctive graph representation,
Bulletin of the Polish Academy of Sciences, s.Computer Science 
47, 
1999, 
pp.103-114
185.
J.Błażewicz, S.Gawiejnowicz,
Scheduling tasks and vehicles in a flexible manufacturing systems,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
24, 
1999, 
pp.3-12
186.
J.Błażewicz, P.Formanowicz, M.Kasprzak, W.T.Markiewicz, J.Węglarz,
DNA sequencing with positive and negative errors,
Journal of Computational Biology 
6, 
1999, 
pp.113-123
187.
J.Błażewicz, A.Hertz, D.Kobler, D.de Werra,
On some properties of DNA graphs,
Discrete Applied Mathematics 
98, 
1999, 
pp.1-19
188.
J.Błażewicz, M.Drozdowski, F.Guinand, D.Trystram,
Scheduling a divisible task in a 2-dimensional toroidal mesh,
Discrete Applied Mathematics 
94, 
1999, 
pp.35-50
189.
J.Błażewicz, P.Formanowicz, M.Kasprzak, J.Węglarz,
Informtyka a biologia obliczeniowa,
Pro Dialog 
8, 
1999, 
pp.11-26
190.
J.Błażewicz, G.Pawlak, M.Sterna, B.Walter, M.Zawirski,
Heuristic algorithm for schedule optimization in FMS environment,
Foundations of Computing and Decision Science 
24, 
1999, 
pp.189-207
191.
J. Błażewicz, P. Dell'Olmo, M. Drozdowski,
Scheduling of client-server applications,
International Transactions in Operational Research 
6, 
1999, 
pp. 345-363

1998

192.
W.Kubiak J.Błażewicz, M.Dror, N.Katoh. H.Röck,
Resource constrained chain scheduling of UET jobs on two machines,
Operations Research 
46, 
1998, 
pp.742-746
193.
J.Błażewicz, M.Drozdowski, P.Formanowicz, W.Kubiak,
Szeregowanie zadań w systemach z ograniczoną dostępnocią maszyn,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej s.Automatyka 
123, 
1998, 
pp.55-63
194.
J.Błażewicz, E.Pesch, M.Sterna,
Nowa reprezentacja maszynowa grafu dysjunkcyjnego dla problemu szeregowania w ogólnym systemie obsługi,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej s.Automatyka 
123, 
1998, 
pp.45-54
195.
J.Błażewicz, G.Finke, M-L.Espinouse,G.Pawlak,
Scheduling vehicles in a cyclic flexible flowshops,
European J. of Automation 
32, 
1998, 
pp.441-452
196.
J.Błażewicz, G.Pawlak,
Modelowanie szeregowania zadań i wózków w elastycznych przepływowych systemach obsługi,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej s.Automatyka 
124, 
1998, 
pp.9-17

1997

197.
J.Błażewicz, J.Kaczmarek, M.Kasprzak, W.Markiewicz, J.Węglarz,
Sequential and parallel algorithms for DNA sequencing,
CABIOS 
13, 
1997, 
pp.151-158
198.
J.Błażewicz, M.Kasprzak, M.Sterna, J.Węglarz,
Selected combinatorial optimization problems arising in molecular biology,
Ricerca Operativa 
26, 
1997, 
pp.35-63
199.
I.Bianco, J.Błażewicz, P.Dell' Olmo, M.Drozdowski,
Preemptive multiprocessor tasks scheduling with release timesand time windows,
Annals of Operations Research 
70, 
1997, 
pp-43-55
200.
L.Bianco, J.Błażewicz,P.Dell' Olmo, M.Drozdowski,
Linear algorithms for preeemptive scheduling of multiprocessor tasks subject to minimal lateness,
Discrete Applied Mathematics 
72, 
1997, 
pp.25-46
201.
J.Błażewicz, M.Drozdowski,
Distributed processing of divisible jobs with communication startup costs,
Discrete Applied Mathematics 
76, 
1997, 
pp-21-41
202.
J.Błażewicz, A.Cysewska-Sobusiak, A.Lerczak, M.Kasprzak, W. Markiewicz,
Parameter analysis of clusters of melting temperatures of DNA chains,
Computational Methods in Science and Technology 
3, 
1997, 
pp.7-13

1996

203.
J.Błażewicz,M.Drozdowski,
Performance limits of a two-dimensional network of load-sharing processors,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
2, 
1996, 
pp.3-15
204.
J.Błażewicz, W.Domschke, E.Pesch,
The job shop scheduling problem : Conventional and new solution techniques,
European Journal of Operational Research 
93, 
1996, 
pp.1-33
205.
J.Błażewicz, Z.Liu,
Scheduling multiprocessor tasks with chain constraints,,
European Journal of Operational Research 
94, 
1996, 
pp.231-241
206.
J.Błażewicz, P.Bouvry, F.Guinard, D.Trystram,
Scheduling complete in-trees on two uniform processors with communication delays,
Information Processing Letters 
58, 
1996, 
pp-255-263
207.
J.Błażewicz, M.Drozdowski, D.de Werra, J.Węglarz,
Deadline scheduling of multiprocessor tasks,,
Discrete Applied Mathematics 
65, 
1996, 
pp.81-99
208.
J.Błażewicz, J.Kaczmarek, M.Kasprzak, W.T.Markiewicz, J Węglarz,
Sequential algorithms for DNA sequencing,,
Computational Methods in Science and Technology 
1, 
1996, 
pp.31-42
209.
J.Błażewicz, L.Gwóźdź, M.Kasprzak, M.Przysucha,
A comparison of two DNA sequencing methods,,
Computational Methods in Science and Technology 
2, 
1996, 
pp.17-32

1995

210.
J. Błażewicz, R. Walkowiak,
A local search approach for two-dimensional irregular cutting,
OR Spektrum 
17, 
1995, 
pp.93-98
211.
L.Bianco, J.Błażewicz, P.Dell'Olmo, M.Drozdowski,
Scheduling multiprocessor tasks on a dynamic configuration of dedicated processors,
Annals of Operations Research 
58, 
1995, 
pp.493-517
212.
J.Błażewicz, M.Drozdowski,
Scheduling divisible jobs on hypercubes,
Parallel Computing 
21, 
1995, 
pp. 1945-1956
213.
J.Błażewicz, J.R.Nawrocki,
Dwustopniowe studia informatyczne na Politechnice Poznańskiej,
Komputer w Edukacji 
4, 
1995, 
pp. 23-33

1994

214.
J.Błażewicz, P.Dell`Olmo, M.Drozdowski, M.G.Speranza,
Scheduling multiprocessor tasks on three dedicated processors,
Corrigendum Information Processing Letters 
49, 
1994, 
pp.269-270
215.
J. Błażewicz, R. Burkard, G. Finke, G. Woeginger,
Vehicle scheduling in two-cycle flexible manufacturing systems,
Mathematical and Computer Modelling 
20, 
1994, 
pp.19-31
216.
J. Błażewicz, D.P. Bovet, J. Brzeziński, G. Gambosi, M. Talamo,
Optimal centralized algorithms for store-and-forward deadlock avoidance,
IEEE Trans. Computers 
43, 
1994, 
pp.1333-1338
217.
J. Błażewicz, M. Drozdowski, G. Schmidt, D. de Werra,
Scheduling independent multiprocessor tasks on a uniform k-processor system,
Parallel Computing 
20, 
1994, 
pp.15-28
218.
J. Błażewicz, K. Ecker,
Multiprocessor task scheduling with resource requirements,
Real Time Systems 
6, 
1994, 
pp.37-53
219.
L. Bianco, J. Błażewicz, P. dell'Olmo, M. Drozdowski,
Scheduling preemptive multiprocessor tasks on dedicated processors,
Performance Evaluation 
20, 
1994, 
pp.361-371
220.
J. Błażewicz, M. Drozdowski, J. Węglarz,
Scheduling multiprocessor tasks: A survey,
International Journal of Microcomputer Applications 
13, 
1994, 
pp.89-97
221.
J. Błażewicz, R. Walkowiak,
DSS for two-dimensional cutting - new tools improving feasible solution,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
19, 
1994, 
pp.285-298
222.
J. Błażewicz, M. Drozdowski, J.Węglarz,
Szeregowanie zadań wieloprocesorowych na alternatywnych zbiorach procesorów dedykowanych,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej s.Automatyka 
114, 
1994, 
pp.13-25
223.
J. Błażewicz, G. Finke,
Scheduling with resource management in manufacturing systems,
European J. of Operational Research 
76, 
1994, 
pp.1-14
224.
J. Błażewicz, M. Dror, G.Pawlak, K.Stecke,
A note on flexible flowshop scheduling with two-stages,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
19, 
1994, 
pp.159-172
225.
L.Bianco, J.Błażewicz, P.Dell`Olmo, M.Drozdowski,
Scheduling UET multiprocessor tasks,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
19, 
1994, 
pp.273-283

1993

226.
J. Błażewicz, M. Drozdowski, J. Węglarz,
Szeregowanie zadań wieloprocesorowych,
Postępy Cybernetyki 
1993, 
227.
J. Błażewicz, W. Kubiak , S. Martello,
Algorithms for minimizing maximum lateness with unit length tasks and resource constraints,
Discrete Applied Mathematics 
42, 
1993, 
pp.123-138
228.
J. Błażewicz, J. Brzeziński, G. Gambosi,
Graph theoretical issues in computer networks,
European J. of Operational Research 
71, 
1993, 
pp.1-16
229.
J. Błażewicz, P. Hawryluk, R. Walkowiak,
Using a tabu search approach for solving two-dimensional irregular cutting problem,
Annals of Operations Research 
41, 
1993, 
pp.313-325
230.
J. Błażewicz, M. Drozdowski,
Szeregowanie zadań wieloprocesorowych w systemach równoległych,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej s.Informatyka 
24, 
1993, 
pp.77-88
231.
Bianco, J. Błażewicz, P. dell'Olmo, M. Drozdowski,
Preemptive scheduling of multiprocessor tasks on the dedicated processor system subject to minimal lateness,
Information Processing Letters 
46, 
1993, 
pp.109-113

1992

232.
J. Błażewicz, M. Drozdowski,
Szeregowanie zadań wieloprocesorowych przed liniami krytycznymi,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej s.Automatyka 
109, 
1992, 
pp.19-28
233.
J. Błażewicz, A. Piechowiak, R. Walkowiak,
Defining two-dimensional irregular figures for automatic cutting system,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
17, 
1992, 
pp.3-12
234.
S.P. Sethi, G. Sorger, C. Sriskandarajah J. Błażewicz, W. Kubiak,
Sequencing of robot moves and multiple parts in a robotic cell,
International Journal of FMS 
4, 
1992, 
pp.331-358
235.
J. Błażewicz, J. Brzeziński, G. Gambosi,
Optimization aspects of deadlock prevention in store-and-forward networks,
European J.of Operational Research 
57, 
1992, 
pp.1-12
236.
J.Błażewicz, P.Dell`Olmo, M.Drozdowski, M.G.Speranza,
Scheduling multiprocessor tasks on three dedicated processors,
Information Processing Letters 
41, 
1992, 
pp.275-280

1991

237.
D. de Werra,J.Błażewicz, W.Kubiak,
A preemptive open shop scheduling problem with one resource,
Operations Research Letters 
10, 
1991, 
pp.9-15
238.
J. Błażewicz, H. Eiselt, G. Finke, G. Laporte, J. Węglarz,
Scheduling tasks and vehicles in a flexible manufacturing system,
International Journal of FMS 
4, 
1991, 
pp.5-16
239.
D. de Werra, J. Błażewicz,
Preemptive open shop scheduling with renewable and nonrenewable resources,
Discrete Applied Mathematics 
35, 
1991, 
pp.205-219
240.
J. Błażewicz, G. Finke, G. Laporte, J. Węglarz,
Dynamic programming algorithm for a FMS Scheduling problem,
Bull. of the Polish Acad. of Sci. (Tech. Sci.) 
39, 
1991, 
pp.345-350
241.
J. Błażewicz, M. Dror, J. Węglarz,
Mathematical programming formulations for machine scheduling,
European Journal of Operational Research 
51, 
1991, 
pp.283-300

1990

242.
J. Błażewicz,
Nowe modele w teorii szeregowania zadań – złożonoć obliczeniowa problemów szeregowania zadań,
Zeszyty Naukowe Politechniki Rzeszowskiej 
72, 
1990, 
pp.10-12
243.
J. Błażewicz, J. Brzeziński,
Problemy zapobiegania zakleszczeniom w sieciach komputerowych z komutacją pakietów,
Zeszyty Naukowe Politechniki Rzeszowskiej 
72, 
1990, 
pp.13-14
244.
J. Błażewicz, M. Drozdowski, G. Schmidt, D. de Werra,
Scheduling independent two processor tasks on a uniform duo-processor system,
Discrete Applied Mathematics 
28, 
1990, 
pp.11-20
245.
J. Błażewicz, J. Węglarz,
O pewnym problemie szeregowania detali i wózków w elastycznym systemie produkcyjnym,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej s.Automatyka 
101, 
1990, 
pp.325-331
246.
J. Błażewicz, M. Drozdowski, G. Schmidt, D. de Werra,
Minimizing schedule length in duo-processor systems,
Wissenschaftlische Berichte der TH Leipzig 
11, 
1990, 
pp.4-10
247.
J. Błażewicz, M. Drozdowski, B. Soniewiecki, R. Walkowiak,
Decision support system for cutting irregular shapes - implementation and experimental comparison,
Foundations of Computing and Decision Sciences 
15, 
1990, 
pp.121-129

1989

248.
J. Błażewicz, G. Laporte,
Routing and scheduling within a job-shop framework,
Foundations of Control Engineering 
14, 
1989, 
pp.53-60

1988

249.
J. Błażewicz, G. Finke, R. Haupt, G. Schmidt,
New trends in scheduling theory,
European J.of Operational Research 
37, 
1988, 
pp.303-317
250.
J. Błażewicz, W. Kubiak, J. Szwarcfiter,
Scheduling unit-time tasks on flow-shops under resource constraints,
Annals of Operations Research 
16, 
1988, 
pp.255-266
251.
J. Błażewicz, S. Osiak, B. Soniewiecki, R. Walkowiak,
System wspomagania podejmowania decyzji w zagadnieniach rozkroju,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej 
94, 
1988, 
pp.29-39
252.
J. Błażewicz, M. Drozdowski, J. Węglarz,
Szeregowanie zadań wieloprocesorowych w systemie jednorodnych duoprocesorów,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej 
94, 
1988, 
pp.41-48
253.
J. Błażewicz, J. Brzeziński, G. Gambosi,
Optimal algorithm for prevention of different deadlock types in store-and-forward computer networks,
Bull. of the Polish Acad. of Sci. (Tech. Sci.) 
36, 
1988, 
pp.65-74

1987

254.
J. Błażewicz, J. Brzeziński, G. Gambosi,
Time-stamps approach to store-and-forward deadlock prevention,
IEEE Trans. on Communications 
35, 
1987, 
pp.490-495
255.
J. Błażewicz, J. Brzeziński, G. Gambosi,
Time-stamps approach to prevention of different deadlock types in store-and-forward networks,
IEEE Trans. on Communications 
35, 
1987, 
pp.564-566
256.
J. Błażewicz, J. Węglarz,
Złożonoć obliczeniowa problemów szeregowania zadań na maszynach z ograniczeniami zasobowymi,
Archiwum Automatyki i Telemechaniki 
28, 
1987, 
pp.3-33
257.
J. Błażewicz,
Selected topics in scheduling theory,
Annals of Discrete Mathematics 
31, 
1987, 
pp.1-60
258.
J. Błażewicz, G. Finke,
Minimizing mean weighted execution time loss on identical and uniform processors,
Information Processing Letters 
24, 
1987, 
pp.259-263
259.
J.Błażewicz, W. Kubiak, H. Röck, J.Szwarcfiter,
Minimizing mean flow time with parallel processors and resource constraints,
Acta Informatica 
24, 
1987, 
pp.513-524

1986

260.
J. Błażewicz, J. Barcelo, W. Kubiak, H. Röck,
Scheduling tasks on two processors with deadlines and additional resources,
European J. of Operational Research 
25, 
1986, 
pp.364-370
261.
J. Błażewicz, M. Drabowski, J. Węglarz,
Scheduling multiprocesor tasks to minimize schedule length,
IEEE Trans. on Computers 
35, 
1986, 
pp.389-393

1985

262.
J. Błażewicz, J. Nawrocki,
Dynamic storage allocation with limited compaction-complexity and some practical implications,
Discrete Applied Mathematics 
10, 
1985, 
pp.241-253

1984

263.
J. Błażewicz,
Minimizing mean weighted information loss with preemptible tasks and parallel processors,
Technology and Science of Informatics 
1984, 
pp.415-420
264.
J. Błażewicz, D. Bovet, G.Gambosi,
Deadlock resistant flow control procedures for store-and-forward networks,
IEEE Trans. on Communications CoM-32 
1984, 
pp.884-887
265.
J. Błażewicz, M. Drabowski, J. Węglarz,
O niektórych problemach szeregowania zadań wieloprocesorowych,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej,s.Automatyka 
z.84, 
1984, 
pp.39-48
266.
J. Błażewicz, M. Drabowski, J. Węglarz,
Scheduling independent 2-processors tasks to minimize schedule length,
Information Processing Letters 
18, 
1984, 
pp.267-273
267.
J. Błażewicz, M. Drabowski, J. Węglarz,
On the complexity of scheduling multiprocessor tasks in micropocessor systems,
Bull. Pol. Ac. Sci. Tech. Sci. 
32, 
1984, 
pp.591-600

1983

268.
J. Błażewicz,
Minimizing mean weighted execution time loss on parallel machines,
Methods of Operations Research 
52, 
1983, 
pp.415-425
269.
J. Błażewicz, K. Ecker,
A polynomial in time algorithm for task scheduling under fixed resources constraints,
Foundations of Control Engineering 
8, 
1983, 
pp.3-7
270.
J. Błażewicz, K. Ecker,
A linear intime algorithm for restricted bin packing and scheduling problem,
Operations Research Letters 
2, 
1983, 
pp.80-83
271.
J. Błażewicz, J.K. Lenstra, A.H.G. Rinnooy Kan,
Scheduling subject to resource constraints: classification and complexity,
Discrete Applied Mathematics 
5, 
1983, 
pp.11-24
272.
J. Błażewicz, A. Pettorossi,
Some properties of binary sequences useful for proving Collatz's conjecture,
Foundations of Control Engineering 
8, 
1983, 
pp.53-63

1982

273.
J. Błażewicz,
Wielomianowe algorytmy szeregowania zadań na równoległych maszynach przy ograniczeniach zasobowych,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej s. Automatyka 
z.63, 
1982, 
pp.11-17

1981

274.
J. Błażewicz,
Solving the resource constrained deadline scheduling problem via reduction to the network flow problem,
European J. of Operational Research 
6, 
1981, 
pp.75-79

1980

275.
J. Błażewicz,
Wielomianowe i pseudowielomianowe algorytmy rozwiązywania problemów kombinatorycznych,
Archiwum Automatyki i Telemechaniki 
25, 
1980, 
pp.355-366
276.
J. Błażewicz,
Szeregowanie zadań na dedykowanych maszynach przy ograniczeniach zasobowych,
Zeszyty Naukowe Politechniki Śląskiej s.Automatyka 
z.54, 
1980, 
p.9-17

1979

277.
J. Błażewicz,
Deadline scheduling of tasks with ready times and resource constraints,
Information Processing Letters 
8, 
1979, 
pp.60-63
278.
J. Błażewicz,
Scheduling tasks on parallel processors under resource constraints to minimize mean finishing time,
Methods of Operations Research 
35, 
1979, 
pp.67-72

1978

279.
J. Błażewicz, J. Węglarz,
Deteministyczne problemy szeregowania zadań na procesorach systemów komputerowych z uwzględnieniem dodatkowych zasobów,
Archiwum Automatyki i Telemechaniki 
23, 
1978, 
pp.485-509
280.
J. Błażewicz, J. Węglarz,
Scheduling to meet deadlines with resource constraints-complexity results,
Tanulmanyok of Hungarian Academy of Sciences 
78, 
1978, 
pp.5-21

1977

281.
J. Błażewicz,
Simple algorithms for multiprocessor scheduling to meet deadlines,
Information Processing Letters 
6, 
1977, 
pp.162-164
282.
J. Błażewicz, W. Cellary, J. Węglarz,
A strategy for scheduling splittable tasks to reduce schedule length,
Acta Cybernetica 
3, 
1977, 
pp.99-106
283.
J. Błażewicz, W. Cellary, J. Węglarz,
Scheduling splittable tasks on parallel processors to minimize schedule length,
MTA SzTAKI Kózlemenyek of Hungarian Academy of Science 
18, 
1977, 
pp.139-147
284.
J. Węglarz, J. Błażewicz, W. Cellary, R. Słowiński,
An automatic revised simplex method for constrained resource network scheduling,
ACM Transactions on Mathematical Software 
3, 
1977, 
pp.295-300

1976

285.
J. Błażewicz,
Deadline scheduling of tasks - A survey,
Foundations of Control Engineering 
1, 
1976, 
pp.203-216
286.
J. Błażewicz, W. Cellary,
Some computational problems of scheduling dependent and preemptive tasks to minimize schedule length,
Foundations of Control Engineering 
1, 
1976, 
pp.75-82
287.
J. Błażewicz, W. Cellary, R. Słowiński, J. Węglarz,
A comparison of two specialized versions of the revised simplex method for finding the time-optimal control of a complex of operations,
Foundations of Control Engineering 
1, 
1976, 
pp.103-122
288.
J. Błażewicz, W. Cellary, R. Słowiński, J. Węglarz,
Deterministyczne problemy szeregowania zadań na równoległych procesorach, Cz.I. Zbiory zadań niezależnych,
Podstawy Sterowania 
6, 
1976, 
pp.155-178
289.
J. Błażewicz, W. Cellary, R. Słowiński, J. Węglarz,
Deterministyczne problemy szeregowania zadań na równoległych procesorach, Cz.II. Zbiory zadań zależnych,
Podstawy Sterowania 
6, 
1976, 
pp.297-320.