Krzysztof Krawiec


Home

Research:

edit SideBar

Zaburzenia krazenia mozgowego u czlowieka sa badanie za pomoca pomiarów predkosci przeplywu medodą ultrasonografii dopplerowskiej przez naczynia doprowadzające krew do mózgu. Na tej podstawie mozna okreslic zwezenie w pojedynczym naczyniu, jednak ze wzgledu na bardzo zlozona strukture tych naczyn oraz ich strukturalna zmiennosc w populacji brak normy uwzgledniającej taką wariancje oraz przede wszystkim hierarchicznosc zaburzen przeplywu tj jesli zaburzenie jest w naczyniu w szyji to trudno sie spodziewac normy w naczyniu w mozgu, a jesli taka "norma" jest tam obserwowana to tylko ze wzgledu na bardzo zaawansowane mechanizmy adaptacyjne.

Dane:

  • Badanie dla jednego pacjenta obejmuje 8 pomiarow spektrum naczyn szyjnych oraz 13 wewnatrzczaszkowych.
  • Kazdy pomiar spektrum redukuje sie do trzech cech, dwoch wspolczynnikow tych cech oraz parametru kontrolnego (kąta insonacji).
  • Daje to razem 21 naczyn * (3 cechy, 2 wspolczynniki cech) ~ 105 elementow dla badania pacjenta.
  • Mamy aktualnie 1220 badan (w sumie okolo 1100 unikatowych pacjentow)

Dostepny ultrasonograf posiada juz opracowana w polowie ostatniej dekady modalnosc dicom SR (structured reporting), ktora umozliwia przechowywanie i ekstrakcje danych w plikach dicom o strukturze podobnej do xml. Dane sa dostepne w formacie dicom SR.

Zadania:

  • Napisac parser plikow Dicom SR i jednoczesnie konwerter do formatu tabelarycznego (w najprostszym przypadku CSV)
  • Przeprowadzic wstepna analize danych (statystyki opisowe, prosta analiza zaleznosci pomiedzy atrybutami), z wykorzytaniem pakietow R i/lub WEKA.

Przykładowe pliki (rozszerzenia txt dodane w zwiazku z wymogami PMWiki):

Referencje:


Powered by PmWiki