APACS: Analytic Picture Archiving and Communication System
Alternatywne rozwinięcie skrótu: Analytic Picture Analysis and Consultation System :)
Poniższy opis ma na celu uzgodnienie wizji systemu pomiędzy realizatorami projektu i wypracowanie spójnej terminologii.
Na skróty:
Cele i motywacje:
- badawcze:
- wspomaganie zarządzania dużymi eksperymentami badawczymi (liczba badań >100) w obszarze neurologii, radiologii, i neuroobrazowania,
- rozwijanie nowych algorytmów przetwarzania i analizy obrazów KT/MRI (w szczególności wnioskujących na wyższych poziomach abstrakcji niż pojedyncze voksele),
- nowe implementacje istniejących algorytmów przetwarzania i analizy obrazów
- w szczególności szybkie implementacje na GPU
- kliniczne:
- polepszenie skuteczności diagnostycznej
- aspekt prawny: pominięcie informacji diagnostycznej która była dostępna w momencie podejmowania decyzji jest traktowane jako błąd w sztuce
- przyspieszenie procesu podejmowania decyzji na podstawie danych obrazowych
- wykrywanie trudno obserwowalnych zmian w czasie (nawet jeżeli dwa badania wykonane w pewnym odstępie czasu są prawidłowe, to ich analiza różnicowa może prowadzić do istotnych wniosków)
Założenia:
- dane wejściowe na których operuje system:
- dane obrazowe (KT, MRI, ...)
- dane kliniczne (wiek, płeć, waga, ...)
- system składa się z dwóch głównych komponentów:
- platformy do wygodnego definiowania i wykonywania procedur przetwarzania danych obrazowych i klinicznych; dalej: framework, Framework
- poszczególnych algorytmów przetwarzania danych; dalej: algorytm, Algorytmy
- prace nad APACSem i wtyczkami prowadzimy równolegle, zakładając że zintegrujemy je później przy pomocy Plugin interface (rys.)
- obecnie zakładamy że wtyczki czytają dane wejściowe z plików (NIFTI) i zapisują wyniki do plików w tym formacie,
- inne założenia:
- eksperymenty wykonywane są w trybie offline z racji zazwyczaj dużych kosztów czasowych
Scenariusze użycia:
- badawczy (exploratory mode): eksperymentator:
- zasila system danymi obrazowymi przez interfejs DICOM
- definiuje eksperyment za pomocą interfejsu webowego, wybierając:
- odpowiednie algorytmy przetwarzania i analizy obrazu (wtyczki)
- pulę obrazów do przeanalizowania
- uruchamia eksperyment (który w ogólności może trwać bardzo długo)
- w trakcie trwania eksperymentu, może śledzić jego postępy przez interfejs webowy
- po zakończeniu eksperymentu jest o tym zawiadamiany przez APACSa emailem
- kliniczny (rapid response mode): lekarz:
- wysyła do systemu pojedyncze badanie (dane obrazowe DICOM + kliniczne)
- wskazuje na procedurę diagnostyczną (procedurę wspomagania decyzji) którą chce wykorzystać
- dostaje wynik działania procedury w postaci obrazu DICOM
W tym semestrze skupiamy się głównie na realizacji scenariusza badawczego.
Kryteria oceny:
- dla APACS:
- kompletność, tj. zdolność do całościowej realizacji eksperymentów (wg podanego scenariusza użycia),
- dla algorytmów:
- skuteczność diagnostyczna
- złożoność czasowa (w szczególności w klinicznym scenariuszu użycia)
Inne