Bioinformatyka strukturalna RNA
Strona przedmiotu na platformie eKursySala wykładowa: CW 6
Plan wykładów
| Wykład 1 | Struktura drugorzędowa RNA: klasyfikacja, reprezentacje, formaty zapisu danych |
| Wykład 2 | Próbkowanie chemiczne, predykcja struktury 2D, ocena predykcji, odwrotne zwijanie |
| Wykład 3 | Wizualizacja struktury 3D, reprezentacje i formaty zapisu struktury 3D, adnotowanie struktury |
| Wykład 4 | Wprowadzenie do transformerów |
| Wykład 5 | Eksperymentalne określanie i przewidywanie struktury 3D |
| Wykład 6 | Metody porównywania i oceny podobieństwa modeli 3D RNA |
| Wykład 7 | Metody obliczeniowe w dynamice molekularnej |
| Wykład 8 | Eksperymenty Monte Carlo w bioinformatyce strukturalnej |
Egzamin z przedmiotu
Pytania egzaminacyjne sprawdzają zarówno znajomość teorii jak i umiejętności praktyczne. Egzamin składa się z szeregu pytań, za które można uzyskać maksymalnie 20 punktów. Skala ocen w zależności od liczby uzyskanych punktów jest następująca:
| suma punktów |
0.0 – 10.0 | 10.1 – 12.0 | 12.1 – 14.0 |
14.1 – 16.0 | 16.1 – 18.0 | 18.1 – 20.0 |
| ocena końcowa |
2.0 | 3.0 | 3.5 | 4.0 | 4.5 | 5.0 |
Uwaga: obecność na wykładach z przedmiotu skutkuje uzyskaniem przez studenta dodatkowych punktów, które doliczane są do sumy uzyskanej za odpowiedzi na pytania egzaminacyjne.
Zagadnienia na egzamin