Środa - Bioinformatyka |
Tematyka zajęć |
10.03.2021 |
Wprowadzenie do sekwencjonowania - wykład |
17.03.2021 |
Preprocessing, wstępne przetwarzanie danych z sekwencjonowania - lab, termin oddania: |
24.03.2021 |
Resekwencjonowanie, mapowanie do genomu referencyjnego - wykład |
31.03.2021 |
Resekwencjonowanie - lab, termin oddania: |
07.04.2021 |
Resekwencjonowanie kontynuacja - lab (konsultacje) |
14.04.2021 |
Przeprowadzanie eksperymentu mikromacierzowego - wykład |
21.04.2021 |
Analiza eksperymentu mikromacierzowego, lab, limma, termin oddania: 28.04.2021 |
28.04.2021 |
Sekwencjonowanie RNA. Różnicowa ekspresja genów - wyklad |
05.05.2021 |
Dzień wolny od zajęć dydaktycznych |
12.05.2021 |
Analiza różnicowa mikroRNA w R, lab link do danych, porównania,phenoData,termin oddania: 19.05.2021 |
19.05.2021 |
Asemblacja de novo - wykład |
26.05.2021 |
Asemblacja de novo transkryptomu, lab, pliku w katalogu /home/lab3, termin oddania: 02.06.2021 |
02.06.2021 |
Wykrywanie wariantów strukturalnych w genomie - wykład |
09.06.2021 |
Wizualizacja w IGV lab |
16.06.2021 |
Prezentacje / Kolokwium z wykładów |