Analiza danych wysokoprzepustowych - Bioinformatyka 2 stopien, 2 semestr

Back


Plan zajęć


Środa - Bioinformatyka Tematyka zajęć
10.03.2021 Wprowadzenie do sekwencjonowania - wykład
17.03.2021 Preprocessing, wstępne przetwarzanie danych z sekwencjonowania - lab, termin oddania:
24.03.2021 Resekwencjonowanie, mapowanie do genomu referencyjnego - wykład
31.03.2021 Resekwencjonowanie - lab, termin oddania:
07.04.2021 Resekwencjonowanie kontynuacja - lab (konsultacje)
14.04.2021 Przeprowadzanie eksperymentu mikromacierzowego - wykład
21.04.2021 Analiza eksperymentu mikromacierzowego, lab, limma, termin oddania: 28.04.2021
28.04.2021 Sekwencjonowanie RNA. Różnicowa ekspresja genów - wyklad
05.05.2021 Dzień wolny od zajęć dydaktycznych
12.05.2021 Analiza różnicowa mikroRNA w R, lab link do danych, porównania,phenoData,termin oddania: 19.05.2021
19.05.2021 Asemblacja de novo - wykład
26.05.2021 Asemblacja de novo transkryptomu, lab, pliku w katalogu /home/lab3, termin oddania: 02.06.2021
02.06.2021 Wykrywanie wariantów strukturalnych w genomie - wykład
09.06.2021 Wizualizacja w IGV lab
16.06.2021 Prezentacje / Kolokwium z wykładów