Zastosowania Informatyki w Medycynie
Godziny zajęć
Wtorek 9:45 BT 1.6.21.
Oceny i obecność
Lista zajęć
Nr | Data | Grupa | Temat |
1. | 28.02 | Wszyscy | Wprowadzenie do tomografu komputerowego |
2. | 7.03 | -- | Konsultacje |
3. | 14.03 | Wszyscy | Konsultacje |
4. | 21.03 | -- | Konsultacje |
5. | 28.03 | Wszyscy | Oddanie projektu i sprawozdania: tomograf komputerowy; ocena 0-5 |
6. | 4.04 | Wszyscy | Wprowadzenie do uczenia maszynowego [materiały] |
7. | 11.04 | Wszyscy | Wprowadzenie do wyszukiwarek tekstu [materiały]; wybór projektu II |
8. | 25.04 | --- | Konsultacje |
9. | 9.05 | Grupa A | Prezentacja oprogramowania; ocena binarna 0-1 |
10. | 16.05 | Grupa B | Prezentacja oprogramowania; ocena binarna 0-1 |
11. | 23.05 | Grupa A | Oddanie kompletnego projektu II; ocena binarna za przyrost 0-1 |
12. | 30.05 | Grupa B | Oddanie kompletnego projektu II; ocena binarna za przyrost 0-1 |
13. | 6.06 | Wszyscy | Prezentacja kompletnego projektu II; ocena końcowa projektu II: 0-5 |
14. | 13.06 | Wszyscy | Prezentacja kompletnego projektu II; ocena końcowa projektu II: 0-5 |
Zasady zaliczenia zajęć
- Zajęcia są zaliczane na podstawie realizacji dwóch projektów.
- Tematem projektu I jest realizacja symulatora tomografu komputerowego. Temat projektu II należy wybrać do 7. zajęć.
- Każdy projekt mogą realizować maksymalnie dwie osoby.
- W ramach projektu I należy przygotować kompletne oprogramowanie i sprawozdanie z pracy, oceniane łącznie na 0-5 punktów.
- Zakres sprawozdania: (8-12 stron): opis problemu i sposobu jego rozwiązania (algorytmy, dokładny formalny opis oraz przykład, rysunki techniczne wyjaśniające ideę działania), napotkane trudności podczas prac, architektura, technologie, wnioski i perspektywa rozwoju.
- Terminem realizacji projektu I są 5. zajęcia.
- Projekt II realizowany jest etapowo:
- Zajęcia 9/10: Prezentacja projekt z częściowo zrealizowaną funkcjonalnością, ocena binarna: 0-1 punktów
- Zajęcia 11/12: Oddanie projektu z całkowicie zrealizowaną funkcjonalnością, ocena binarna: 0-1 punktów
- Zajęcia 13/14: Prezentacja projektu przed publicznością na żywo (około 15min), ocena końcowa zrealizowanej funkcjonalności: 0-5 punktów
- O przydziale grup projektowych do terminów realizacji na zajęciach parzystych/nieparzystych decyduje prowadzący na zajęciach 7.
- Ocena końcowa wynika z sumy uzyskanych punktów:
- ≤6.0p: 2.0,
- ≤7.2p: 3.0,
- ≤8.4p: 3.5,
- ≤9.6p: 4.0,
- ≤10.8p: 4.5,
- >10.8p: 5.0.
- Pracę należy wysłać pocztą elektroniczną na adres e-mail prowadzącego zajęcia nie później niż do godziny 0:00 w dniu zajęć, na których praca ma zostać zaprezentowana.
- Jako datę i godzinę przyjęcia pracy przez prowadzącego zajęcia przyjmuje się stopkę czasową dostarczenia wiadomości zawierającej projekt lub pracę pisemną wg zegara serwera poczty prowadzącego.
- Za każdy dzień spóźnienia oddania pracy na punkt kontrolny, punkty cząstkowe są obniżane o 0,1.
- Obecność jest obowiązkowa na:
- zajęciach 1, 3, 5-7, 13, 14,
- punktach kontrolnych wyznaczonych dla danej grupy projektowej (A/B).
- Nieobecność na zajęciach nie zwalnia z terminowego oddania pracy.
- Za każdą z wyjątkiem pierwszej nieusprawiedliwioną nieobecność na zajęciach wymienionych powyżej ocena końcowa jest obniżana o 0,5.
- Ostatnim dniem zaliczenia przedmiotu "w pierwszym terminie" jest ostatni dzień okresu zajęć dydaktycznych w semestrze, w którym realizowany jest przedmiot (16.06.2016).
- Ostatnim dniem zaliczenia poprawkowego przedmiotu jest dzień zaliczenia poprawkowego określony w harmonogramie sesji ogłaszanym przez dziekanat.
- W szczególnych przypadkach prowadzący zajęcia może przesunąć termin zaliczenia, o czym informacja zostanie zamieszczona z minimum dwutygodniowym wyprzedzeniem na tej stronie.
Tematy projektów i prac zaliczeniowych
Projekty zaliczeniowe
Projekt zaliczeniowy może zostać wybrany przez maksymalnie dwa zespoły w ramach grupy laboratoryjnej.
- Symulator działania tomografu komputerowego
- Wyszukiwarka publikacji medycznych bazująca na PubMed i MeSH
- Rejestrator aktywności fizycznej
- Segmentacja obrazów siatkówki oka
- Telekonsultacje
- Analiza danych z testu grafomotorycznego - diagnostyka choroby Parkinsona. Film z przykładową aplikacją.
- Analiza danych medycznych
- System wizualizacji zanieczyszczenia powietrza
- Atlas medyczny 3D
Archiwum: Hasła Wikipedii
Hasła Wikipedii przygotowane w latach ubiegłych:
- Robot medyczny (indeks studenta: 98433)
- Proteza (indeks studenta: 100988)
- Diagnostyka obrazowa (indeks studenta: 100743)
- HL7 (Health Level Seven) (indeks studenta: 100383)
- Międzynarodowa klasyfikacja chorób (indeks studenta: 101876)
- Radiologia (indeks studenta: 100636)
- Interfejs mózg-komputer (indeks studenta: 100910)
- System archiwizacji obrazu i komunikacji (PACS) (indeks studenta: 106519)
- DICOM (indeks studenta: 106595)
- Medycyna nuklearna (indeks studenta: 106592)
- Ultrasonografia (indeks studenta: 89729)
- Badania SPECT (indeks studenta: 106618)
- Bioinformatyka (indeks studenta: 106549)
- Neuroinformatyka (indeks studenta: 106604)
- Funkcjonalny magnetyczny rezonans jądrowy (fMRI) (indeks studenta: 109716)
- Angiografia (indeks studenta: 106523)
- Obrazowanie przedkliniczne (Preclinical imaging) (indeks studenta: 109693)
- Badania prenatalne (indeks studenta: 106544)
Materiały do zajęć
Opis działania tomografu komputerowego i rekonstrukcji obrazu z filtrowaniem [link].
Przykłady obrazów DICOM (w tym mózgu):
- http://www.rubomed.com/dicomfiles/index.html
- Enhanced Multiframe CT (NEMA)
- http://support.dcmtk.org/wiki/dicom/images
Przykłady obrazów MRI mózgu:
- http://brainmaps.org/index.php?action=viewslides&datid=17
- http://muineach.com/joomla/index.php?option=com_content&task=view&id=17&Itemid=1 (guz)
- Enhanced Multiframe MR (NEMA)
Listy leków:
- Lista leków dopuszczonych do obrotu w Polsce (.pdf)
- Lista leków dopuszczonych do obrotu w Polsce (.xls)
- Lista leków refundowanych (.xls)
Wikipedia: