Podejścia systemowe w badaniach biomedycznych

Kierunek

Bioinformatyka

Rok

II rok (semestr 3), studia II stopnia

Semestr

Semestr letni 2026/2027

Formy zajęć

Wykład, ćwiczenia, laboratorium

Prowadzę od

2020/2021

Wymiar

15 h wykładu, 10 h ćwiczeń, 20 h laboratorium · 3 ECTS

O przedmiocie

Zastosowanie metod biologii i medycyny systemowej do badania mechanizmów chorób, poszukiwania biomarkerów, celów terapeutycznych i leków. Na laboratoriach studenci analizują dane biomedyczne z użyciem zaawansowanych metod statystycznych i uczenia maszynowego, a na ćwiczeniach przedstawiają własne projekty badawcze.

Od roku akademickiego 2025/2026 przedmiot ma zwiększony wymiar godzin i obejmuje także laboratorium. Obecnie prowadzony jest wspólnie z dr Anastasiią Satyr.

Tematy zajęć

Wykład

1. Wprowadzenie do badań systemowych w medycynie
2. Identyfikacja biomarkerów i badania przesiewowe
3. Zaawansowana statystyka w badaniach medycznych
4. Redukcja wymiarowości
5. Badania asocjacyjne całego genomu (GWAS)
6. Onkologia precyzyjna
7. Wnioskowanie przyczynowe w badaniach biomedycznych i badaniach klinicznych
8. Uogólnione modele liniowe w medycynie
9. Zastosowania sztucznej inteligencji w medycynie i biologii

Laboratorium

1. Statystyka w badaniach medycznych
2. Redukcja wymiarowości
3. Badania asocjacyjne całego genomu (GWAS)
4. Farmakogenomika
5. Wnioskowanie przyczynowe w badaniach biomedycznych i badaniach klinicznych
6. Uogólnione modele liniowe w medycynie
7. Automatyzacja ekstrakcji wiedzy i analizy układów biomedycznych metodami sztucznej inteligencji
8. Cyberbiobezpieczeństwo i zagrożenia związane ze sztuczną inteligencją
9. Identyfikacja i walidacja biomarkerów chorób

Ćwiczenia

1. Prezentacja i dyskusja własnych projektów badawczych o charakterze systemowym

Kod przedmiotu: S2Bioinf2>PSBB. Aktualna karta przedmiotu (ECTS) jest dostępna w systemie USOSweb.

Materiały i ogłoszenia

Wszystkie informacje o kursie, materiały dydaktyczne oraz zasady zaliczenia znajdują się na platformie eKursy.

Przejdź do eKursów

Konsultacje

Wtorki, 13:30–15:00, pok. 2.6.46 (ECBiG). Proszę o wcześniejszy kontakt mailowy — dane kontaktowe.