{"id":110,"date":"2021-02-04T14:47:43","date_gmt":"2021-02-04T13:47:43","guid":{"rendered":"http:\/\/localhost\/mSzachniuk\/?page_id=110"},"modified":"2025-12-29T21:57:12","modified_gmt":"2025-12-29T20:57:12","slug":"tematy-prac","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/teaching\/tematy-prac\/","title":{"rendered":"Prace mgr-lic-in\u017c"},"content":{"rendered":"\n<script>\ndocument.getElementById(\"menu-item-188\").classList.add(\"current_page_item\");\n<\/script>\n<a href=\"..\/\">Informacje dla student\u00f3w<\/a> <<\n\n\n\n<h1 class=\"wp-block-heading\"><strong>Tematy prac magisterskich, in\u017cynierskich i licencjackich<\/strong><\/h1>\n\n\n\n<p align=\"justify\">Poni\u017cszy spis obejmuje tematy prac w dziedzinie informatyki, bioinformatyki i biologii obliczeniowej (w kolejno\u015bci od najnowszych do najstarszych) wystawionych przeze mnie i wykonane pod moim nadzorem. W nawiasach podano wykonawc\u00f3w i rok obrony pracy.<\/p>\n\n<h3>Prace magisterskie<\/h3>\n<ol reversed=\"\">\n   <li>Analiza tr\u00f3jwymiarowych struktur genom\u00f3w wirusowych (F. Kokoci\u0144ski; 2026)<\/li>\n   <li>Modelowanie struktury niekanonicznych motyw\u00f3w RNA z wykorzystaniem uczenia maszynowego (P. H\u0142adki; 2026)<\/li>\n   <li>Wykrywanie i-motyw\u00f3w w strukturach molekularnych (J. Marciniak; 2025)<\/li>\n   <li>Projekt i implementacja aplikacji mobilnej do wyszukiwania po\u0142\u0105cze\u0144 kolejowych oraz analiza GUI z naciskiem na do\u015bwiadczenie u\u017cytkownika (J. Zi\u0119tek; 2024)<\/li>\n   <li>MolDock Challenge &#8211; wst\u0119p do gry w dokowanie (M. Fr\u0105ckowiak, A. Mizera; 2021)<\/li>\n   <li>Nowy algorytm dopasowywania struktur 3D RNA (M. \u017burkowski; 2019)<\/li>\n   <li>Od analizy ci\u0105g\u00f3w znakowych do wizualizacji kompromisu (P. Wegrzak; 2019)<\/li>\n   <li>Nowy algorytm do identyfikacji w\u0119z\u0142\u00f3w w strukturach RNA (D. Muzyka; 2018)<\/li>\n   <li>Modelowanie struktury przestrzennej RNA z zastosowaniem modeli gruboziarnistych (M. Osowiecki; 2017)<\/li>\n   <li>Bioinformatyczna analiza motyw\u00f3w w strukturach ro\u015blinnych mikroRNA (J. Kowalska, K. Rybicka; 2015)<\/li>\n   <li>Wizualizacja struktury drugorz\u0119dowej RNA na ekranie dotykowym (K. Janas; 2012)<\/li>\n   <li>Bakteryjne sRNA w mikrobiomie cz\u0142owieka &#8211; bioinformatyczna analiza danych (J. Porzuczek; 2012)<\/li>\n   <li>Bioserwer: administracja systemem i wizualizacja danych (T. Tokarek; 2012)<\/li>\n   <li>Wysoko-przepustowa statystyczna analiza parametr\u00f3w struktur bia\u0142kowych (M. Szewczyk; 2012)<\/li>\n   <li>Nowa metoda por\u00f3wnywania struktur molekularnych (T. \u017bok; 2011)<\/li>\n   <li>Algorytmy modelowania struktury RNA na GPU (S. Kaczmarek; 2011)<\/li>\n   <li>Repozytorium element\u00f3w strukturalnych kwas\u00f3w nukleinowych &#8211; projekt i implementacja (S. Bosy; 2011)<\/li>\n   <li>Statystyka element\u00f3w strukturalnych RNA (P. Mulczy\u0144ski; 2011)<\/li>\n   <li>RNAComposer: budowanie przestrzennej struktury RNA (N. Bartol; 2010)<\/li>\n   <li>RNACompare: narz\u0119dzie do por\u00f3wnywania struktur RNA (A. Starikiewicz; 2010)<\/li>\n   <li>Konstruowanie \u015bcie\u017cek transferowych na widmach NMR (M. Ma\u0142aczy\u0144ski; 2009)<\/li>\n   <li>Wyszukiwarka fragment\u00f3w RNA &#8211; projekt i implementacja (M. B\u0142a\u017cewicz; 2008)<\/li>\n   <li>Baza drugorz\u0119dowych struktur cz\u0105steczek RNA (W. Paczkowski; 2008)<\/li>\n   <li>Algorytmy wspomagaj\u0105ce rozwi\u0105zywanie i wyszukiwanie struktur RNA (M. Mi\u0142awski; 2008)<\/li>\n   <li>Analiza algorytmiczna NMR-owskich widm \u0142a\u0144cuch\u00f3w proteinowych (L. Ko\u015bci\u0144ski; 2006)<\/li>\n   <li>Trzeciorz\u0119dowa struktura RNA &#8211; problematyka informatyczna (S. Klemczak; 2005)<\/li>\n   <li>Kombinatoryczna analiza wynik\u00f3w eksperymentu NMR (A. W\u00f3jtowicz; 2003)<\/li>\n <\/ol>\n\n<h3>Prace in\u017cynierskie<\/h3>\n<ol reversed=\"\">\n<li>RNAgrainy: uziarnianie struktury RNA (M. Konon, S. Urbaniak; 2026)<\/li>\n<li>Lokalna ocena jako\u015bci modeli 3D RNA (D. Grajek, L. Niedzia\u0142kowska, J. Paw\u0142owska, P. Walczak; 2025)<\/li>\n<li>Wizualizacja sieci interakcji w strukturze 3D RNA (A. Pustelnyk, N. Tsishevskaya; 2025)<\/li>\n<li>ONQUADRO: zaawansowana wyszukiwarka danych (K. Kremis, K. Matecki, F. Kokosza, D. \u0141ukasiewicz; 2023)<\/li>\n<li>Mechanizmy zarz\u0105dzania wyzwaniami na platformie RNA-Puzzles (J. Ciechanowicz, P. Sztuczka; 2022)<\/li>\n   <li>Rozw\u00f3j prototypu platformy internetowej RNA-Puzzles (J. Raczynski, E. Szpotanski, J. Tadej, P. Tomaszewski; 2021)<\/li>\n   <li>Projekt oraz implementacja portalu RNApolis (N. Lukasiewicz, W. Orczyk, B. Piaskowski; 2020)<\/li>\n   <li>Projekt oraz implementacja platformy internetowej RNA-Puzzles (L. Eckert, M. Frackowiak, A. Mizera; 2020)<\/li>\n   <li>Baza danych multip\u0119tli RNA (I. Bogdanov, F. Neunert, V. Zastup; 2020)<\/li>\n   <li>Nowa metoda identyfikacji pseudow\u0119z\u0142\u00f3w (M. \u017burkowski;2018)<\/li>\n   <li>RNAsprite &#8211; narz\u0119dzie do oblicze\u0144 danych strukturalnych RNA (P. Ceranek; 2017)<\/li>\n   <li>Serwer narz\u0119dzi bioinformatycznych (M. Jackowski, S. Sza\u0142ata, M. Szewczyk, T. Tokarek; 2011)<\/li>\n   <li>RNAComposer: baza danych i system obs\u0142ugi u\u017cytkownik\u00f3w hurtowych (S. Bosy, K. Klukowski, P. Mulczy\u0144ski, R. Szulc; 2010)<\/li>\n   <li>Por\u00f3wnywanie i \u0142\u0105czenie fragment\u00f3w RNA (T. \u017bok; 2010)<\/li>\n   <li>Baza danych fragment\u00f3w RNA (N. Bartol, G. Kaczmarek, A. Starikiewicz, J. Staszak; 2009)<\/li>\n   <li>NMR-corner: Internetowa platforma do oblicze\u0144 NMR-owskich (L. Chojnacki, P. Kiec, G. Skibi\u0144ski, D. Zieli\u0144ski; 2008)<\/li>\n   <li>Automatyczna analiza widm NMR cz\u0105steczek RNA (M. Mi\u0142awski, W. Paczkowski; 2007)<\/li>\n<\/ol>\n\n<h3>Prace licencjackie<\/h3>\n<ol reversed=\"\">\n<li>Analiza konformacji komputerowych modeli 3D RNA (H. P\u0119kalski; 2023)<\/li>\n<li>Bioinformatyczna analiza konformacji kwadrupleks-ligand (A. Zaleski; 2023)<\/li>\n<li>W\u0142a\u015bciwo\u015bci zap\u0119tlonych struktur RNA (A. Korpeta; 2021)<\/li>\n   <li>Modelowanie struktury RNA z udzia\u0142em danych eksperymentalnych (K. Figurski; 2019)<\/li>\n   <li>Webserver dla bazy danych kwadrupleks\u00f3w (P. Pielaci\u0144ska; 2019)<\/li>\n   <li>Algorytm ci\u0119cia i sk\u0142adania du\u017cych cz\u0105steczek RNA (J. Szymanowska; 2018)<\/li>\n   <li>Wyszukiwarka pseudow\u0119z\u0142\u00f3w w strukturach RNA (M. Podeszwa; 2018)<\/li>\n   <li>Bioinformatyczne metody analizy pseudow\u0119z\u0142\u00f3w RNA (S. Adamczak; 2018)<\/li>\n   <li>Zastosowanie komputerowych symulacji dynamiki molekularnej do bada\u0144 konformacyjnych pseudow\u0119z\u0142a RNA (M. Osowiecki; 2015)<\/li>\n   <li>\u0141amig\u0142\u00f3wki strukturalne w \u015bwiecie RNA (M. Przyby\u0142a; 2013)<\/li>\n   <li>Tydzie\u0144 z \u017cycia bazy struktur RNA (W. Tomy\u015blak; 2013)<\/li>\n   <li>RNA w szklanej kuli, czyli o przewidywaniu struktur (J. Kowalska; 2013)<\/li>\n<\/ol>\n\n<h3>Praca dyplomowa: <\/h3><a href=\"..\/materialy\/\">formatowanie, obrona, przydatne linki.<\/a>\n\n\n\n<p><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Informacje dla student\u00f3w<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":102,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"custom-page.php","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-110","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/110","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=110"}],"version-history":[{"count":32,"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/110\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2925,"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/110\/revisions\/2925"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/102"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=110"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}