{"id":104,"date":"2021-02-04T14:44:03","date_gmt":"2021-02-04T13:44:03","guid":{"rendered":"http:\/\/localhost\/mSzachniuk\/?page_id=104"},"modified":"2026-05-11T15:17:15","modified_gmt":"2026-05-11T13:17:15","slug":"bioinformatyka","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/teaching\/bioinformatyka\/","title":{"rendered":"Bioinformatyka strukturalna"},"content":{"rendered":"\n<script>\ndocument.getElementById(\"menu-item-188\").classList.add(\"current_page_item\");\n<\/script>\n<a href=\"..\/\">Informacje dla student\u00f3w<\/a> <<\n\n\n\n<h1 class=\"wp-block-heading\"><strong>Bioinformatyka strukturalna RNA<\/strong><\/h1>\n\n\n\n<a href=\"https:\/\/ekursy.put.poznan.pl\/course\/view.php?id=3527\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Strona przedmiotu na platformie eKursy<\/a>\n<br>\nSala wyk\u0142adowa: CW 6\n\n<h3>Plan wyk\u0142ad\u00f3w<\/h3>\n<table style=\"text-align: left; width: 100%;\" cellspacing=\"0\" cellpadding=\"2\" border=\"0\">\n  <tbody>\n    <tr>\n      <td style=\"vertical-align: top;\"><span style=\"font-style: italic;\">Wyk\u0142ad&nbsp;1<\/span><\/td>\n      <td style=\"vertical-align: top; text-align: justify;\"><div align=\"justify\">Struktura drugorz\u0119dowa RNA: klasyfikacja, reprezentacje, formaty zapisu danych<br>\n      <\/div><\/td>\n    <\/tr>\n\n    <tr>\n      <td style=\"vertical-align: top;\"><span style=\"font-style: italic;\">Wyk\u0142ad 2<\/span><\/td>\n      <td style=\"vertical-align: top; text-align: justify;\"><div align=\"justify\">Pr\u00f3bkowanie chemiczne, predykcja struktury 2D, ocena predykcji, odwrotne zwijanie<br>\n      <\/div><\/td>\n    <\/tr>\n\n    <tr>\n      <td style=\"vertical-align: top;\"><span style=\"font-style: italic;\">Wyk\u0142ad 3<\/span><\/td>\n      <td style=\"vertical-align: top; text-align: justify;\"><div align=\"justify\">Wizualizacja struktury 3D, reprezentacje i formaty zapisu struktury 3D, adnotowanie struktury<br>\n      <\/div><\/td>\n    <\/tr>\n\n    <tr>\n      <td style=\"vertical-align: top;\"><span style=\"font-style: italic;\">Wyk\u0142ad 4<\/span><\/td>\n      <td style=\"vertical-align: top; text-align: justify;\"><div align=\"justify\">Wprowadzenie do transformer\u00f3w<br>\n      <\/div><\/td>\n    <\/tr>\n\n    <tr>\n      <td style=\"vertical-align: top;\"><span style=\"font-style: italic;\">Wyk\u0142ad 5<\/span><\/td>\n      <td style=\"vertical-align: top; text-align: justify;\"><div align=\"justify\">Eksperymentalne okre\u015blanie i przewidywanie struktury 3D<br>\n      <\/div><\/td>\n    <\/tr>\n\n    <tr>\n      <td style=\"vertical-align: top;\"><span style=\"font-style: italic;\">Wyk\u0142ad 6<\/span><\/td>\n      <td style=\"vertical-align: top; text-align: justify;\"><div align=\"justify\">Metody por\u00f3wnywania i oceny podobie\u0144stwa modeli 3D RNA<br>\n      <\/div><\/td>\n    <\/tr>\n\n    <tr>\n      <td style=\"vertical-align: top;\"><span style=\"font-style: italic;\">Wyk\u0142ad 7<\/span><\/td>\n      <td style=\"vertical-align: top; text-align: justify;\"><div align=\"justify\">Metody obliczeniowe w dynamice molekularnej<br>\n      <\/div><\/td>\n    <\/tr>\n\n    <tr>\n      <td style=\"vertical-align: top;\"><span style=\"font-style: italic;\">Wyk\u0142ad 8<\/span><\/td>\n      <td style=\"vertical-align: top; text-align: justify;\"><div align=\"justify\">Eksperymenty Monte Carlo w bioinformatyce strukturalnej<br>\n      <\/div><\/td>\n    <\/tr>\n\n<\/tbody>\n<\/table>\n<a href=\"..\/..\/wp-content\/uploads\/2021\/02\/Biostru-sylabus.pdf\" target=\"blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Karta opisu przedmiotu (sylabus)<\/a>\n<br>\n\n<h3>Egzamin z przedmiotu<\/h3>\n<p align=\"justify\">\nPytania egzaminacyjne sprawdzaj\u0105 zar\u00f3wno znajomo\u015b\u0107 teorii jak i umiej\u0119tno\u015bci praktyczne. \nEgzamin sk\u0142ada si\u0119 z szeregu pyta\u0144, za kt\u00f3re mo\u017cna uzyska\u0107 maksymalnie 20 punkt\u00f3w. \nSkala ocen w zale\u017cno\u015bci od liczby uzyskanych punkt\u00f3w jest nast\u0119puj\u0105ca: \n<\/p>\n\n<table class=\"matrix\" cellspacing=\"2\" cellpadding=\"2\" bordercolor=\"#ffcc66\" border=\"1\">\n  <tbody>\n    <tr valign=\"middle\">\n      <td> suma<br>punkt\u00f3w<\/td>\n      <td style=\"text-align: center; width: 90px;\" width=\"90\"> 0.0 &#8211; 10.0<\/td>\n      <td style=\"text-align: center; width: 90px;\" width=\"90\">10.1 &#8211; 12.0<\/td>\n      <td style=\"text-align: center; width: 90px;\" width=\"90\"><p>12.1 &#8211;  14.0<\/p><\/td>\n      <td style=\"text-align: center; width: 90px;\" width=\"90\">14.1 &#8211;  16.0<\/td>\n      <td style=\"text-align: center; width: 90px;\" width=\"90\">16.1 &#8211; 18.0<\/td>\n      <td style=\"text-align: center; width: 90px;\" width=\"90\"><p>18.1 &#8211; 20.0<\/p><\/td>\n   <\/tr>\n  <tr>\n      <td style=\"text-align: center; width: 100px;\" width=\"100\" height=\"24\">ocena<br>ko\u0144cowa<\/td>\n      <td style=\"text-align: center; width: 90px;\" width=\"90\">2.0<\/td>\n      <td style=\"text-align: center; width: 90px;\" width=\"90\">3.0<\/td>\n      <td style=\"text-align: center; width: 90px;\" width=\"90\">3.5<\/td>\n      <td style=\"text-align: center; width: 90px;\" width=\"90\">4.0<\/td>\n      <td style=\"text-align: center; width: 90px;\" width=\"90\">4.5<\/td>\n      <td style=\"text-align: center; width: 90px;\" width=\"90\"> 5.0<\/td>\n    <\/tr>\n  <\/tbody>\n<\/table>\n<p align=\"justify\">\nUwaga: obecno\u015b\u0107 na wyk\u0142adach z przedmiotu skutkuje uzyskaniem przez studenta dodatkowych punkt\u00f3w, \nkt\u00f3re doliczane s\u0105 do sumy uzyskanej za odpowiedzi na pytania egzaminacyjne. \n<\/p>\n<a href=\"..\/..\/wp-content\/uploads\/2021\/02\/biostru_egz.pdf\" target=\"blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Zagadnienia na egzamin<\/a>\n\n\n\n<p><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Informacje dla student\u00f3w<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":102,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"custom-page.php","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-104","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/104","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=104"}],"version-history":[{"count":41,"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/104\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":3112,"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/104\/revisions\/3112"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/102"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.cs.put.poznan.pl\/mszachniuk\/site\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=104"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}