• Tworzenie klasycznych sieci Petriego do modelowania systemów biologicznych
   doi:10.1093/bioinformatics/btac540 [Boinformatics]
   doi:10.24425/119060 [Bulletin of the Polish Academy of Sciences. Technical Sciences]

• Analiza klasycznych sieci Petriego: analiza niezmienników, zbiorów MCT, analiza klastrów
   doi:10.1016/j.jbi.2013.07.013 [Journal of Biomedical Informatics]

• Zastosowanie sieci Petriego w medycynie
   doi:10.1016/j.biosystems.2018.01.002 [Biosystems]
   doi:10.1371/journal.pone.0173020 [PLOS ONE]
   doi:10.1038/srep18332 [Scientific Reports]
   doi:10.3390/ijms21093348 [International Journal of Molecular Sciences]
   doi:10.3390/ijms21228574 [International Journal of Molecular Sciences]
   doi:10.3390/biology11030430 [Biology]
   doi.org/10.3390/app13106149 [Applied Sciences]

• Inne modele sieci: czasowe, probabilistyczne, funkcjonalne, ciągłe, hybrydowe
   doi:10.1093/bioinformatics/btx492 [Bioinformatics]

• Mechanizmy naprawy DNA: Base Excision Repair (BER)
   doi: 10.1371/journal.pone.0217913 [PLOS ONE]

• Mechanizmy naprawy DNA: Nucleotide Excision Repair (NER)

Sekwencjonowanie przez hybrydyzację

• Nieklasyczne SBH: Alternating Chip, Binary Chip, Gapped Chip
   PhD Thesis
   doi: 10.1007/s12539-017-0220-0 [Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences]
   doi:10.1007/s12539-017-0220-0 [Przegląd Elektrotechniczny]

• Nieklasyczne SBH: badanie złożoności obliczeniowej
   PhD Thesis

• Inne problemy związane z SBH
   doi:10.12921/cmst.2018.0000055 [Computational Methods in Science and Technology]
   doi:10.1016/j.compbiolchem.2016.01.010 [Computational Biology and Chemistry]

• Automatyczna identyfikacja, przetwarzanie i analizowanie informacji w tekstach
   doi:10.1016/j.ecoinf.2012.07.003 [Ecological Informatics]

• ABC transportery w roślinach
   doi.org/10.1007/s00018-023-04751-6 [Cellular and Molecular Life Sciences]


 doi:10.1094/MPMI-22-8-0921 [Molecular Plant-Microbe Interactions]