From Krzysztof Krawiec

ADHD: ADHD

New

Cel

Wygrać konkurs Konkurs ADHD-200, takze http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/adhd200/index.html, czyli:

Dane wejściowe

Uwagi:

Oczekiwane wyjście:

Wizja dataflow

A. Wstepne przetwarzanie danych

1. Segmentacja mózgu (skullstripping)

  1. algorytm BET2 - Brain Extraction Tool
  2. (opcja) BSE (część BrainSuite)

2 Segmentacja FAST do 3 kategorii strona techniczna FAST

Dalsza analiza dotyczy wyłącznie wokseli GM, choć inne też będą wykorzystane np. do estymacji fluktuacji pola magnetycznego.

3 FLIRT to korejestracji z BOLD

3.1 Korzystamy z rejestracji liniowej z szescioma stopniami swobody

4 Korejestracja do atlasu za pomoca FLIRT i wygenerowanie zagregowanych przebiegów BOLD dla poszczególnych struktur mózgu

4.1 Alternatywnie możemy uzyć FNIRT czyli narzedzie rejestracji elastycznej

5 opcja: FIRST - segmentacja struktur podkorowych, na bazie atlasu;

Zdjecie tablicy:

Konieczność odszumienia spektrum przebiegu czasowego obrazu ze względu na obecność:

B. Ekstrakcja cech

Cel: stworzenie (w miarę zwartej) reprezentacji danych otrzymanych z etapu A. Na dziś zakładamy że proces ten byłby raczej nienadzorowany, czyli nie korzystałby z rozpoznań pacjentów.

Zakładane dane wejściowe: zagregowane przebiegi dla poszczególnych struktur mózgu (lub pojedynczych wokseli)

Grupy cech:

C. Klasyfikacja

Cel: Przygotowanie i nauczenie klasyfikatorów diagnozujących pacjentów na podstawie reprezentacji (jednej lub wielu) otrzymanych z etapu B

Zdjęcie tablicy z 23 Marca

Przypisanie zadań do zespołów

(dla uproszczenia pozwalam sobie adresowac Was po imieniu)

Wspólne zadania dla wszystkich

Michał Przemko Wojtek Jarek Mateusz Tomasz Krzysztof:

Otwarte kwestie/pytania:

(prosze nie usuwac pytan tylko dopisywac odpowiedzi)

Specyfikacja implementacji Dataflow

Preprocessing danych

Skrypt do przekształcenia surowych przebiegów czasowych w pliki zawierające cechy przeznaczone do klasyfikacji:

dane zawarte w nazwie pliku:

  • typ danych (np. przebieg czasowy, przetworzony przebieg czasowy, etc.)

Klasyfikacja:

Komentarze do implementacji Dataglow:

Literatura:

Klasyfikator

Retrieved from http://www.cs.put.poznan.pl/kkrawiec/wiki/?n=ADHD.ADHD
Page last modified on August 30, 2011, at 11:23 AM